Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4X3

CCL27, C-C motif chemokine 27, humanhuman

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Length 112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL27Q9Y4X3 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCL27Q9Y4X3 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCL27Q9Y4X3 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCL27Q9Y4X3 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCL27Q9Y4X3 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCL27Q9Y4X3 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCL27Q9Y4X3 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCL27Q9Y4X3 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCL27Q9Y4X3 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCL27Q9Y4X3 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCL27Q9Y4X3 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCL27Q9Y4X3 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CCL27Q9Y4X3 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CCL27Q9Y4X3 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCL27Q9Y4X3 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCL27Q9Y4X3 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCL27Q9Y4X3 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCL27Q9Y4X3 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCL27Q9Y4X3 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCL27Q9Y4X3 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCL27Q9Y4X3 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCL27Q9Y4X3 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCL27Q9Y4X3 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCL27Q9Y4X3 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCL27Q9Y4X3 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCL27Q9Y4X3 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCL27Q9Y4X3 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCL27Q9Y4X3 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCL27Q9Y4X3 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCL27Q9Y4X3 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCL27Q9Y4X3 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCL27Q9Y4X3 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCL27Q9Y4X3 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCL27Q9Y4X3 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCL27Q9Y4X3 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCL27Q9Y4X3 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCL27Q9Y4X3 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCL27Q9Y4X3 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCL27Q9Y4X3 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCL27Q9Y4X3 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCL27Q9Y4X3 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCL27Q9Y4X3 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCL27Q9Y4X3 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCL27Q9Y4X3 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCL27Q9Y4X3 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCL27Q9Y4X3 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CCL27Q9Y4X3 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCL27Q9Y4X3 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCL27Q9Y4X3 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCL27Q9Y4X3 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCL27Q9Y4X3 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CCL27Q9Y4X3 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCL27Q9Y4X3 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCL27Q9Y4X3 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCL27Q9Y4X3 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCL27Q9Y4X3 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCL27Q9Y4X3 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCL27Q9Y4X3 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCL27Q9Y4X3 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCL27Q9Y4X3 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCL27Q9Y4X3 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCL27Q9Y4X3 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCL27Q9Y4X3 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCL27Q9Y4X3 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCL27Q9Y4X3 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCL27Q9Y4X3 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCL27Q9Y4X3 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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CCL27Q9Y4X3 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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CCL27Q9Y4X3 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCL27Q9Y4X3 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCL27Q9Y4X3 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCL27Q9Y4X3 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCL27Q9Y4X3 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCL27Q9Y4X3 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCL27Q9Y4X3 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CCL27Q9Y4X3 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCL27Q9Y4X3 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCL27Q9Y4X3 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCL27Q9Y4X3 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CCL27Q9Y4X3 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCL27Q9Y4X3 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CCL27Q9Y4X3 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CCL27Q9Y4X3 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCL27Q9Y4X3 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCL27Q9Y4X3 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCL27Q9Y4X3 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCL27Q9Y4X3 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CCL27Q9Y4X3 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCL27Q9Y4X3 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCL27Q9Y4X3 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCL27Q9Y4X3 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCL27Q9Y4X3 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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