Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC9

NPC1L1, Niemann-Pick C1-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPC1L1Q9UHC9 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NPC1L1Q9UHC9 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
NPC1L1Q9UHC9 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NPC1L1Q9UHC9 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NPC1L1Q9UHC9 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NPC1L1Q9UHC9 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NPC1L1Q9UHC9 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NPC1L1Q9UHC9 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NPC1L1Q9UHC9 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NPC1L1Q9UHC9 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NPC1L1Q9UHC9 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NPC1L1Q9UHC9 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NPC1L1Q9UHC9 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NPC1L1Q9UHC9 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NPC1L1Q9UHC9 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NPC1L1Q9UHC9 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NPC1L1Q9UHC9 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NPC1L1Q9UHC9 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NPC1L1Q9UHC9 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
NPC1L1Q9UHC9 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NPC1L1Q9UHC9 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NPC1L1Q9UHC9 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
NPC1L1Q9UHC9 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NPC1L1Q9UHC9 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NPC1L1Q9UHC9 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NPC1L1Q9UHC9 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NPC1L1Q9UHC9 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
NPC1L1Q9UHC9 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NPC1L1Q9UHC9 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NPC1L1Q9UHC9 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NPC1L1Q9UHC9 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NPC1L1Q9UHC9 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NPC1L1Q9UHC9 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NPC1L1Q9UHC9 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NPC1L1Q9UHC9 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NPC1L1Q9UHC9 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NPC1L1Q9UHC9 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NPC1L1Q9UHC9 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NPC1L1Q9UHC9 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
NPC1L1Q9UHC9 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NPC1L1Q9UHC9 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NPC1L1Q9UHC9 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NPC1L1Q9UHC9 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NPC1L1Q9UHC9 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NPC1L1Q9UHC9 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
NPC1L1Q9UHC9 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NPC1L1Q9UHC9 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NPC1L1Q9UHC9 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NPC1L1Q9UHC9 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NPC1L1Q9UHC9 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NPC1L1Q9UHC9 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NPC1L1Q9UHC9 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NPC1L1Q9UHC9 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NPC1L1Q9UHC9 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NPC1L1Q9UHC9 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NPC1L1Q9UHC9 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NPC1L1Q9UHC9 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NPC1L1Q9UHC9 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
NPC1L1Q9UHC9 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NPC1L1Q9UHC9 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NPC1L1Q9UHC9 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NPC1L1Q9UHC9 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NPC1L1Q9UHC9 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NPC1L1Q9UHC9 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NPC1L1Q9UHC9 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NPC1L1Q9UHC9 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NPC1L1Q9UHC9 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NPC1L1Q9UHC9 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NPC1L1Q9UHC9 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NPC1L1Q9UHC9 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NPC1L1Q9UHC9 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NPC1L1Q9UHC9 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NPC1L1Q9UHC9 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NPC1L1Q9UHC9 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NPC1L1Q9UHC9 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NPC1L1Q9UHC9 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NPC1L1Q9UHC9 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
NPC1L1Q9UHC9 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NPC1L1Q9UHC9 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NPC1L1Q9UHC9 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
NPC1L1Q9UHC9 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NPC1L1Q9UHC9 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NPC1L1Q9UHC9 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NPC1L1Q9UHC9 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NPC1L1Q9UHC9 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NPC1L1Q9UHC9 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NPC1L1Q9UHC9 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NPC1L1Q9UHC9 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NPC1L1Q9UHC9 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NPC1L1Q9UHC9 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NPC1L1Q9UHC9 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NPC1L1Q9UHC9 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NPC1L1Q9UHC9 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NPC1L1Q9UHC9 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NPC1L1Q9UHC9 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NPC1L1Q9UHC9 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NPC1L1Q9UHC9 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NPC1L1Q9UHC9 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NPC1L1Q9UHC9 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NPC1L1Q9UHC9 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms