Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP4

DKK3, Dickkopf-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK3Q9UBP4 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DKK3Q9UBP4 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DKK3Q9UBP4 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DKK3Q9UBP4 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DKK3Q9UBP4 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DKK3Q9UBP4 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DKK3Q9UBP4 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DKK3Q9UBP4 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DKK3Q9UBP4 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DKK3Q9UBP4 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DKK3Q9UBP4 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DKK3Q9UBP4 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DKK3Q9UBP4 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DKK3Q9UBP4 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DKK3Q9UBP4 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DKK3Q9UBP4 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DKK3Q9UBP4 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DKK3Q9UBP4 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DKK3Q9UBP4 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DKK3Q9UBP4 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DKK3Q9UBP4 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DKK3Q9UBP4 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
DKK3Q9UBP4 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DKK3Q9UBP4 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DKK3Q9UBP4 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DKK3Q9UBP4 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DKK3Q9UBP4 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DKK3Q9UBP4 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DKK3Q9UBP4 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DKK3Q9UBP4 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DKK3Q9UBP4 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DKK3Q9UBP4 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DKK3Q9UBP4 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DKK3Q9UBP4 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DKK3Q9UBP4 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DKK3Q9UBP4 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DKK3Q9UBP4 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DKK3Q9UBP4 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DKK3Q9UBP4 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DKK3Q9UBP4 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DKK3Q9UBP4 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DKK3Q9UBP4 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DKK3Q9UBP4 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DKK3Q9UBP4 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DKK3Q9UBP4 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DKK3Q9UBP4 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DKK3Q9UBP4 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DKK3Q9UBP4 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DKK3Q9UBP4 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DKK3Q9UBP4 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DKK3Q9UBP4 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DKK3Q9UBP4 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DKK3Q9UBP4 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DKK3Q9UBP4 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DKK3Q9UBP4 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DKK3Q9UBP4 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DKK3Q9UBP4 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DKK3Q9UBP4 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DKK3Q9UBP4 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DKK3Q9UBP4 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DKK3Q9UBP4 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DKK3Q9UBP4 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
DKK3Q9UBP4 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DKK3Q9UBP4 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DKK3Q9UBP4 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DKK3Q9UBP4 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DKK3Q9UBP4 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DKK3Q9UBP4 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DKK3Q9UBP4 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DKK3Q9UBP4 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DKK3Q9UBP4 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DKK3Q9UBP4 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DKK3Q9UBP4 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DKK3Q9UBP4 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DKK3Q9UBP4 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DKK3Q9UBP4 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DKK3Q9UBP4 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DKK3Q9UBP4 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DKK3Q9UBP4 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DKK3Q9UBP4 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DKK3Q9UBP4 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DKK3Q9UBP4 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DKK3Q9UBP4 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DKK3Q9UBP4 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DKK3Q9UBP4 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DKK3Q9UBP4 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DKK3Q9UBP4 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DKK3Q9UBP4 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DKK3Q9UBP4 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DKK3Q9UBP4 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DKK3Q9UBP4 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DKK3Q9UBP4 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DKK3Q9UBP4 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DKK3Q9UBP4 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DKK3Q9UBP4 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DKK3Q9UBP4 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DKK3Q9UBP4 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DKK3Q9UBP4 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DKK3Q9UBP4 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DKK3Q9UBP4 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms