Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP0

SPAST, Spastin, humanhuman

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPASTQ9UBP0 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SPASTQ9UBP0 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SPASTQ9UBP0 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SPASTQ9UBP0 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SPASTQ9UBP0 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SPASTQ9UBP0 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SPASTQ9UBP0 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SPASTQ9UBP0 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SPASTQ9UBP0 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SPASTQ9UBP0 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SPASTQ9UBP0 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SPASTQ9UBP0 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SPASTQ9UBP0 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SPASTQ9UBP0 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SPASTQ9UBP0 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SPASTQ9UBP0 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SPASTQ9UBP0 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SPASTQ9UBP0 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SPASTQ9UBP0 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SPASTQ9UBP0 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SPASTQ9UBP0 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SPASTQ9UBP0 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SPASTQ9UBP0 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SPASTQ9UBP0 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SPASTQ9UBP0 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SPASTQ9UBP0 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SPASTQ9UBP0 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SPASTQ9UBP0 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SPASTQ9UBP0 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SPASTQ9UBP0 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SPASTQ9UBP0 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SPASTQ9UBP0 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SPASTQ9UBP0 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SPASTQ9UBP0 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SPASTQ9UBP0 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SPASTQ9UBP0 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SPASTQ9UBP0 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SPASTQ9UBP0 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SPASTQ9UBP0 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SPASTQ9UBP0 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SPASTQ9UBP0 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SPASTQ9UBP0 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SPASTQ9UBP0 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SPASTQ9UBP0 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SPASTQ9UBP0 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SPASTQ9UBP0 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SPASTQ9UBP0 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SPASTQ9UBP0 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SPASTQ9UBP0 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SPASTQ9UBP0 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SPASTQ9UBP0 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SPASTQ9UBP0 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SPASTQ9UBP0 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SPASTQ9UBP0 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SPASTQ9UBP0 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SPASTQ9UBP0 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SPASTQ9UBP0 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SPASTQ9UBP0 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SPASTQ9UBP0 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SPASTQ9UBP0 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SPASTQ9UBP0 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SPASTQ9UBP0 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SPASTQ9UBP0 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SPASTQ9UBP0 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SPASTQ9UBP0 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SPASTQ9UBP0 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SPASTQ9UBP0 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SPASTQ9UBP0 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SPASTQ9UBP0 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SPASTQ9UBP0 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SPASTQ9UBP0 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SPASTQ9UBP0 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SPASTQ9UBP0 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SPASTQ9UBP0 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SPASTQ9UBP0 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SPASTQ9UBP0 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SPASTQ9UBP0 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SPASTQ9UBP0 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SPASTQ9UBP0 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SPASTQ9UBP0 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SPASTQ9UBP0 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SPASTQ9UBP0 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SPASTQ9UBP0 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SPASTQ9UBP0 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SPASTQ9UBP0 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SPASTQ9UBP0 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SPASTQ9UBP0 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SPASTQ9UBP0 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SPASTQ9UBP0 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SPASTQ9UBP0 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SPASTQ9UBP0 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SPASTQ9UBP0 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SPASTQ9UBP0 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SPASTQ9UBP0 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SPASTQ9UBP0 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SPASTQ9UBP0 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SPASTQ9UBP0 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SPASTQ9UBP0 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SPASTQ9UBP0 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SPASTQ9UBP0 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.6 ms