Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J7

KCMF1, E3 ubiquitin-protein ligase KCMF1, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCMF1Q9P0J7 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCMF1Q9P0J7 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCMF1Q9P0J7 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCMF1Q9P0J7 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCMF1Q9P0J7 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCMF1Q9P0J7 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
KCMF1Q9P0J7 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCMF1Q9P0J7 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCMF1Q9P0J7 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCMF1Q9P0J7 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCMF1Q9P0J7 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCMF1Q9P0J7 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCMF1Q9P0J7 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCMF1Q9P0J7 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCMF1Q9P0J7 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
KCMF1Q9P0J7 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCMF1Q9P0J7 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCMF1Q9P0J7 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCMF1Q9P0J7 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCMF1Q9P0J7 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCMF1Q9P0J7 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCMF1Q9P0J7 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCMF1Q9P0J7 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCMF1Q9P0J7 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCMF1Q9P0J7 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
KCMF1Q9P0J7 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCMF1Q9P0J7 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCMF1Q9P0J7 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCMF1Q9P0J7 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCMF1Q9P0J7 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
KCMF1Q9P0J7 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCMF1Q9P0J7 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KCMF1Q9P0J7 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KCMF1Q9P0J7 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KCMF1Q9P0J7 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KCMF1Q9P0J7 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KCMF1Q9P0J7 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KCMF1Q9P0J7 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KCMF1Q9P0J7 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KCMF1Q9P0J7 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KCMF1Q9P0J7 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KCMF1Q9P0J7 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KCMF1Q9P0J7 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KCMF1Q9P0J7 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KCMF1Q9P0J7 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KCMF1Q9P0J7 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KCMF1Q9P0J7 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KCMF1Q9P0J7 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
KCMF1Q9P0J7 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KCMF1Q9P0J7 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KCMF1Q9P0J7 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KCMF1Q9P0J7 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
KCMF1Q9P0J7 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KCMF1Q9P0J7 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KCMF1Q9P0J7 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KCMF1Q9P0J7 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KCMF1Q9P0J7 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KCMF1Q9P0J7 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KCMF1Q9P0J7 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KCMF1Q9P0J7 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KCMF1Q9P0J7 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KCMF1Q9P0J7 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KCMF1Q9P0J7 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KCMF1Q9P0J7 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KCMF1Q9P0J7 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KCMF1Q9P0J7 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KCMF1Q9P0J7 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KCMF1Q9P0J7 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KCMF1Q9P0J7 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KCMF1Q9P0J7 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KCMF1Q9P0J7 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KCMF1Q9P0J7 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KCMF1Q9P0J7 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KCMF1Q9P0J7 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KCMF1Q9P0J7 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KCMF1Q9P0J7 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KCMF1Q9P0J7 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KCMF1Q9P0J7 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
KCMF1Q9P0J7 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KCMF1Q9P0J7 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KCMF1Q9P0J7 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KCMF1Q9P0J7 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KCMF1Q9P0J7 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KCMF1Q9P0J7 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KCMF1Q9P0J7 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KCMF1Q9P0J7 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KCMF1Q9P0J7 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
KCMF1Q9P0J7 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
KCMF1Q9P0J7 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KCMF1Q9P0J7 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KCMF1Q9P0J7 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KCMF1Q9P0J7 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KCMF1Q9P0J7 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KCMF1Q9P0J7 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KCMF1Q9P0J7 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCMF1Q9P0J7 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCMF1Q9P0J7 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCMF1Q9P0J7 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCMF1Q9P0J7 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCMF1Q9P0J7 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms