Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSB4

KRT82, Keratin, type II cuticular Hb2, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT82Q9NSB4 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KRT82Q9NSB4 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KRT82Q9NSB4 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KRT82Q9NSB4 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KRT82Q9NSB4 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KRT82Q9NSB4 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KRT82Q9NSB4 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KRT82Q9NSB4 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KRT82Q9NSB4 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KRT82Q9NSB4 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KRT82Q9NSB4 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KRT82Q9NSB4 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KRT82Q9NSB4 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KRT82Q9NSB4 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KRT82Q9NSB4 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KRT82Q9NSB4 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KRT82Q9NSB4 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KRT82Q9NSB4 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KRT82Q9NSB4 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KRT82Q9NSB4 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KRT82Q9NSB4 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KRT82Q9NSB4 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KRT82Q9NSB4 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KRT82Q9NSB4 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KRT82Q9NSB4 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KRT82Q9NSB4 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KRT82Q9NSB4 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KRT82Q9NSB4 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KRT82Q9NSB4 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
KRT82Q9NSB4 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
KRT82Q9NSB4 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KRT82Q9NSB4 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KRT82Q9NSB4 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KRT82Q9NSB4 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KRT82Q9NSB4 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KRT82Q9NSB4 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KRT82Q9NSB4 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
KRT82Q9NSB4 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KRT82Q9NSB4 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KRT82Q9NSB4 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KRT82Q9NSB4 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
KRT82Q9NSB4 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KRT82Q9NSB4 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
KRT82Q9NSB4 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KRT82Q9NSB4 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KRT82Q9NSB4 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KRT82Q9NSB4 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KRT82Q9NSB4 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KRT82Q9NSB4 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KRT82Q9NSB4 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
KRT82Q9NSB4 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KRT82Q9NSB4 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KRT82Q9NSB4 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KRT82Q9NSB4 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KRT82Q9NSB4 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KRT82Q9NSB4 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KRT82Q9NSB4 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KRT82Q9NSB4 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KRT82Q9NSB4 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KRT82Q9NSB4 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KRT82Q9NSB4 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KRT82Q9NSB4 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KRT82Q9NSB4 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KRT82Q9NSB4 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KRT82Q9NSB4 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
KRT82Q9NSB4 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
KRT82Q9NSB4 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KRT82Q9NSB4 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KRT82Q9NSB4 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
KRT82Q9NSB4 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KRT82Q9NSB4 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KRT82Q9NSB4 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KRT82Q9NSB4 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KRT82Q9NSB4 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KRT82Q9NSB4 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KRT82Q9NSB4 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
KRT82Q9NSB4 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
KRT82Q9NSB4 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
KRT82Q9NSB4 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KRT82Q9NSB4 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
KRT82Q9NSB4 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KRT82Q9NSB4 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KRT82Q9NSB4 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KRT82Q9NSB4 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KRT82Q9NSB4 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KRT82Q9NSB4 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KRT82Q9NSB4 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KRT82Q9NSB4 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KRT82Q9NSB4 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KRT82Q9NSB4 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KRT82Q9NSB4 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KRT82Q9NSB4 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KRT82Q9NSB4 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KRT82Q9NSB4 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KRT82Q9NSB4 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KRT82Q9NSB4 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KRT82Q9NSB4 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KRT82Q9NSB4 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KRT82Q9NSB4 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KRT82Q9NSB4 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.5 ms