Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI8

FANCF, Fanconi anemia group F protein, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCFQ9NPI8 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FANCFQ9NPI8 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FANCFQ9NPI8 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FANCFQ9NPI8 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FANCFQ9NPI8 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FANCFQ9NPI8 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FANCFQ9NPI8 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FANCFQ9NPI8 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FANCFQ9NPI8 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FANCFQ9NPI8 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FANCFQ9NPI8 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FANCFQ9NPI8 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FANCFQ9NPI8 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FANCFQ9NPI8 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FANCFQ9NPI8 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FANCFQ9NPI8 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FANCFQ9NPI8 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FANCFQ9NPI8 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FANCFQ9NPI8 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FANCFQ9NPI8 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FANCFQ9NPI8 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
FANCFQ9NPI8 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FANCFQ9NPI8 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FANCFQ9NPI8 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
FANCFQ9NPI8 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FANCFQ9NPI8 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
FANCFQ9NPI8 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
FANCFQ9NPI8 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FANCFQ9NPI8 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FANCFQ9NPI8 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
FANCFQ9NPI8 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FANCFQ9NPI8 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
FANCFQ9NPI8 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
FANCFQ9NPI8 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FANCFQ9NPI8 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FANCFQ9NPI8 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FANCFQ9NPI8 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FANCFQ9NPI8 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
FANCFQ9NPI8 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FANCFQ9NPI8 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FANCFQ9NPI8 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FANCFQ9NPI8 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FANCFQ9NPI8 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FANCFQ9NPI8 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FANCFQ9NPI8 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FANCFQ9NPI8 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FANCFQ9NPI8 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FANCFQ9NPI8 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FANCFQ9NPI8 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FANCFQ9NPI8 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FANCFQ9NPI8 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FANCFQ9NPI8 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
FANCFQ9NPI8 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FANCFQ9NPI8 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FANCFQ9NPI8 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FANCFQ9NPI8 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FANCFQ9NPI8 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FANCFQ9NPI8 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FANCFQ9NPI8 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FANCFQ9NPI8 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FANCFQ9NPI8 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FANCFQ9NPI8 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FANCFQ9NPI8 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FANCFQ9NPI8 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FANCFQ9NPI8 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FANCFQ9NPI8 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FANCFQ9NPI8 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FANCFQ9NPI8 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FANCFQ9NPI8 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FANCFQ9NPI8 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FANCFQ9NPI8 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FANCFQ9NPI8 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FANCFQ9NPI8 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FANCFQ9NPI8 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FANCFQ9NPI8 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FANCFQ9NPI8 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FANCFQ9NPI8 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
FANCFQ9NPI8 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FANCFQ9NPI8 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FANCFQ9NPI8 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FANCFQ9NPI8 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FANCFQ9NPI8 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FANCFQ9NPI8 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FANCFQ9NPI8 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
FANCFQ9NPI8 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
FANCFQ9NPI8 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
FANCFQ9NPI8 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FANCFQ9NPI8 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FANCFQ9NPI8 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
FANCFQ9NPI8 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FANCFQ9NPI8 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
FANCFQ9NPI8 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
FANCFQ9NPI8 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FANCFQ9NPI8 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
FANCFQ9NPI8 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FANCFQ9NPI8 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FANCFQ9NPI8 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FANCFQ9NPI8 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FANCFQ9NPI8 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FANCFQ9NPI8 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
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