Protein–RNA interactions for Protein: Q9HDB9

ERVK-5, Endogenous retrovirus group K member 5 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-5Q9HDB9 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
ERVK-5Q9HDB9 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ERVK-5Q9HDB9 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ERVK-5Q9HDB9 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ERVK-5Q9HDB9 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ERVK-5Q9HDB9 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ERVK-5Q9HDB9 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ERVK-5Q9HDB9 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ERVK-5Q9HDB9 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
ERVK-5Q9HDB9 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
ERVK-5Q9HDB9 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ERVK-5Q9HDB9 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ERVK-5Q9HDB9 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
ERVK-5Q9HDB9 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ERVK-5Q9HDB9 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ERVK-5Q9HDB9 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ERVK-5Q9HDB9 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ERVK-5Q9HDB9 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ERVK-5Q9HDB9 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ERVK-5Q9HDB9 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ERVK-5Q9HDB9 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ERVK-5Q9HDB9 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ERVK-5Q9HDB9 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ERVK-5Q9HDB9 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ERVK-5Q9HDB9 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVK-5Q9HDB9 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVK-5Q9HDB9 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVK-5Q9HDB9 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVK-5Q9HDB9 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVK-5Q9HDB9 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVK-5Q9HDB9 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVK-5Q9HDB9 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVK-5Q9HDB9 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVK-5Q9HDB9 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVK-5Q9HDB9 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVK-5Q9HDB9 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVK-5Q9HDB9 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVK-5Q9HDB9 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVK-5Q9HDB9 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVK-5Q9HDB9 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVK-5Q9HDB9 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVK-5Q9HDB9 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVK-5Q9HDB9 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVK-5Q9HDB9 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVK-5Q9HDB9 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVK-5Q9HDB9 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVK-5Q9HDB9 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVK-5Q9HDB9 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVK-5Q9HDB9 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVK-5Q9HDB9 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVK-5Q9HDB9 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVK-5Q9HDB9 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVK-5Q9HDB9 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVK-5Q9HDB9 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVK-5Q9HDB9 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVK-5Q9HDB9 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVK-5Q9HDB9 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVK-5Q9HDB9 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVK-5Q9HDB9 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVK-5Q9HDB9 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVK-5Q9HDB9 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVK-5Q9HDB9 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVK-5Q9HDB9 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERVK-5Q9HDB9 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVK-5Q9HDB9 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVK-5Q9HDB9 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVK-5Q9HDB9 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVK-5Q9HDB9 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVK-5Q9HDB9 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVK-5Q9HDB9 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVK-5Q9HDB9 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVK-5Q9HDB9 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVK-5Q9HDB9 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVK-5Q9HDB9 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVK-5Q9HDB9 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVK-5Q9HDB9 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVK-5Q9HDB9 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVK-5Q9HDB9 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVK-5Q9HDB9 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVK-5Q9HDB9 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVK-5Q9HDB9 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVK-5Q9HDB9 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVK-5Q9HDB9 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVK-5Q9HDB9 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVK-5Q9HDB9 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVK-5Q9HDB9 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVK-5Q9HDB9 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVK-5Q9HDB9 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVK-5Q9HDB9 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVK-5Q9HDB9 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVK-5Q9HDB9 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVK-5Q9HDB9 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVK-5Q9HDB9 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVK-5Q9HDB9 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVK-5Q9HDB9 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVK-5Q9HDB9 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVK-5Q9HDB9 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVK-5Q9HDB9 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVK-5Q9HDB9 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVK-5Q9HDB9 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms