Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV2

TRIM54, Tripartite motif-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM54Q9BYV2 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TRIM54Q9BYV2 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TRIM54Q9BYV2 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM54Q9BYV2 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM54Q9BYV2 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM54Q9BYV2 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM54Q9BYV2 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM54Q9BYV2 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM54Q9BYV2 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM54Q9BYV2 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM54Q9BYV2 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM54Q9BYV2 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM54Q9BYV2 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM54Q9BYV2 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM54Q9BYV2 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM54Q9BYV2 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM54Q9BYV2 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM54Q9BYV2 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM54Q9BYV2 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM54Q9BYV2 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM54Q9BYV2 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM54Q9BYV2 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM54Q9BYV2 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM54Q9BYV2 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM54Q9BYV2 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM54Q9BYV2 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM54Q9BYV2 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM54Q9BYV2 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM54Q9BYV2 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM54Q9BYV2 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM54Q9BYV2 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM54Q9BYV2 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM54Q9BYV2 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM54Q9BYV2 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM54Q9BYV2 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM54Q9BYV2 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM54Q9BYV2 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM54Q9BYV2 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM54Q9BYV2 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM54Q9BYV2 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM54Q9BYV2 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM54Q9BYV2 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM54Q9BYV2 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM54Q9BYV2 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM54Q9BYV2 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM54Q9BYV2 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM54Q9BYV2 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM54Q9BYV2 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM54Q9BYV2 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM54Q9BYV2 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM54Q9BYV2 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM54Q9BYV2 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM54Q9BYV2 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM54Q9BYV2 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM54Q9BYV2 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM54Q9BYV2 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM54Q9BYV2 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM54Q9BYV2 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM54Q9BYV2 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM54Q9BYV2 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM54Q9BYV2 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM54Q9BYV2 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM54Q9BYV2 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM54Q9BYV2 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM54Q9BYV2 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM54Q9BYV2 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM54Q9BYV2 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM54Q9BYV2 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM54Q9BYV2 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM54Q9BYV2 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM54Q9BYV2 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM54Q9BYV2 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM54Q9BYV2 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM54Q9BYV2 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM54Q9BYV2 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM54Q9BYV2 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM54Q9BYV2 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM54Q9BYV2 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM54Q9BYV2 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM54Q9BYV2 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM54Q9BYV2 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM54Q9BYV2 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM54Q9BYV2 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM54Q9BYV2 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM54Q9BYV2 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM54Q9BYV2 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM54Q9BYV2 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM54Q9BYV2 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM54Q9BYV2 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM54Q9BYV2 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM54Q9BYV2 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM54Q9BYV2 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM54Q9BYV2 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM54Q9BYV2 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM54Q9BYV2 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM54Q9BYV2 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM54Q9BYV2 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM54Q9BYV2 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM54Q9BYV2 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM54Q9BYV2 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms