Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYE7

PCGF6, Polycomb group RING finger protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF6Q9BYE7 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PCGF6Q9BYE7 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PCGF6Q9BYE7 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PCGF6Q9BYE7 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PCGF6Q9BYE7 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
PCGF6Q9BYE7 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PCGF6Q9BYE7 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PCGF6Q9BYE7 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PCGF6Q9BYE7 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PCGF6Q9BYE7 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PCGF6Q9BYE7 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PCGF6Q9BYE7 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PCGF6Q9BYE7 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PCGF6Q9BYE7 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PCGF6Q9BYE7 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PCGF6Q9BYE7 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PCGF6Q9BYE7 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PCGF6Q9BYE7 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PCGF6Q9BYE7 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PCGF6Q9BYE7 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PCGF6Q9BYE7 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PCGF6Q9BYE7 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PCGF6Q9BYE7 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PCGF6Q9BYE7 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PCGF6Q9BYE7 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PCGF6Q9BYE7 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PCGF6Q9BYE7 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PCGF6Q9BYE7 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
PCGF6Q9BYE7 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
PCGF6Q9BYE7 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PCGF6Q9BYE7 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
PCGF6Q9BYE7 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
PCGF6Q9BYE7 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
PCGF6Q9BYE7 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
PCGF6Q9BYE7 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
PCGF6Q9BYE7 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
PCGF6Q9BYE7 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
PCGF6Q9BYE7 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
PCGF6Q9BYE7 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PCGF6Q9BYE7 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PCGF6Q9BYE7 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PCGF6Q9BYE7 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PCGF6Q9BYE7 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PCGF6Q9BYE7 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PCGF6Q9BYE7 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PCGF6Q9BYE7 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PCGF6Q9BYE7 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PCGF6Q9BYE7 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
PCGF6Q9BYE7 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PCGF6Q9BYE7 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PCGF6Q9BYE7 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PCGF6Q9BYE7 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PCGF6Q9BYE7 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PCGF6Q9BYE7 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PCGF6Q9BYE7 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PCGF6Q9BYE7 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PCGF6Q9BYE7 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
PCGF6Q9BYE7 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PCGF6Q9BYE7 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PCGF6Q9BYE7 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PCGF6Q9BYE7 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PCGF6Q9BYE7 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PCGF6Q9BYE7 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PCGF6Q9BYE7 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PCGF6Q9BYE7 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PCGF6Q9BYE7 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PCGF6Q9BYE7 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PCGF6Q9BYE7 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PCGF6Q9BYE7 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
PCGF6Q9BYE7 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PCGF6Q9BYE7 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PCGF6Q9BYE7 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PCGF6Q9BYE7 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PCGF6Q9BYE7 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PCGF6Q9BYE7 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
PCGF6Q9BYE7 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PCGF6Q9BYE7 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PCGF6Q9BYE7 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PCGF6Q9BYE7 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PCGF6Q9BYE7 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PCGF6Q9BYE7 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PCGF6Q9BYE7 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PCGF6Q9BYE7 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PCGF6Q9BYE7 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PCGF6Q9BYE7 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PCGF6Q9BYE7 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PCGF6Q9BYE7 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PCGF6Q9BYE7 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PCGF6Q9BYE7 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PCGF6Q9BYE7 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PCGF6Q9BYE7 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PCGF6Q9BYE7 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PCGF6Q9BYE7 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PCGF6Q9BYE7 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PCGF6Q9BYE7 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PCGF6Q9BYE7 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PCGF6Q9BYE7 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PCGF6Q9BYE7 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PCGF6Q9BYE7 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PCGF6Q9BYE7 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms