Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXC9

BBS2, Bardet-Biedl syndrome 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 721 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS2Q9BXC9 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
BBS2Q9BXC9 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BBS2Q9BXC9 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BBS2Q9BXC9 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BBS2Q9BXC9 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BBS2Q9BXC9 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BBS2Q9BXC9 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BBS2Q9BXC9 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BBS2Q9BXC9 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
BBS2Q9BXC9 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
BBS2Q9BXC9 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
BBS2Q9BXC9 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BBS2Q9BXC9 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BBS2Q9BXC9 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BBS2Q9BXC9 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BBS2Q9BXC9 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BBS2Q9BXC9 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BBS2Q9BXC9 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BBS2Q9BXC9 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BBS2Q9BXC9 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BBS2Q9BXC9 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BBS2Q9BXC9 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BBS2Q9BXC9 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BBS2Q9BXC9 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BBS2Q9BXC9 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BBS2Q9BXC9 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BBS2Q9BXC9 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BBS2Q9BXC9 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BBS2Q9BXC9 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BBS2Q9BXC9 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BBS2Q9BXC9 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BBS2Q9BXC9 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BBS2Q9BXC9 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BBS2Q9BXC9 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BBS2Q9BXC9 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
BBS2Q9BXC9 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
BBS2Q9BXC9 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BBS2Q9BXC9 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BBS2Q9BXC9 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BBS2Q9BXC9 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BBS2Q9BXC9 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BBS2Q9BXC9 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BBS2Q9BXC9 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BBS2Q9BXC9 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BBS2Q9BXC9 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BBS2Q9BXC9 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BBS2Q9BXC9 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BBS2Q9BXC9 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BBS2Q9BXC9 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BBS2Q9BXC9 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
BBS2Q9BXC9 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BBS2Q9BXC9 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BBS2Q9BXC9 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BBS2Q9BXC9 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BBS2Q9BXC9 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BBS2Q9BXC9 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BBS2Q9BXC9 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BBS2Q9BXC9 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BBS2Q9BXC9 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BBS2Q9BXC9 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BBS2Q9BXC9 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BBS2Q9BXC9 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BBS2Q9BXC9 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BBS2Q9BXC9 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BBS2Q9BXC9 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BBS2Q9BXC9 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
BBS2Q9BXC9 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BBS2Q9BXC9 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BBS2Q9BXC9 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BBS2Q9BXC9 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
BBS2Q9BXC9 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
BBS2Q9BXC9 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BBS2Q9BXC9 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BBS2Q9BXC9 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BBS2Q9BXC9 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BBS2Q9BXC9 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BBS2Q9BXC9 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BBS2Q9BXC9 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BBS2Q9BXC9 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BBS2Q9BXC9 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BBS2Q9BXC9 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BBS2Q9BXC9 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BBS2Q9BXC9 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BBS2Q9BXC9 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BBS2Q9BXC9 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BBS2Q9BXC9 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BBS2Q9BXC9 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BBS2Q9BXC9 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
BBS2Q9BXC9 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BBS2Q9BXC9 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BBS2Q9BXC9 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BBS2Q9BXC9 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BBS2Q9BXC9 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BBS2Q9BXC9 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BBS2Q9BXC9 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BBS2Q9BXC9 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
BBS2Q9BXC9 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BBS2Q9BXC9 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BBS2Q9BXC9 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BBS2Q9BXC9 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms