Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWX5

GATA5, Transcription factor GATA-5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 397 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATA5Q9BWX5 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GATA5Q9BWX5 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
GATA5Q9BWX5 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GATA5Q9BWX5 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GATA5Q9BWX5 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GATA5Q9BWX5 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GATA5Q9BWX5 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
GATA5Q9BWX5 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GATA5Q9BWX5 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GATA5Q9BWX5 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GATA5Q9BWX5 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GATA5Q9BWX5 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GATA5Q9BWX5 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GATA5Q9BWX5 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GATA5Q9BWX5 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GATA5Q9BWX5 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GATA5Q9BWX5 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GATA5Q9BWX5 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GATA5Q9BWX5 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GATA5Q9BWX5 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GATA5Q9BWX5 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GATA5Q9BWX5 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GATA5Q9BWX5 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
GATA5Q9BWX5 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GATA5Q9BWX5 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GATA5Q9BWX5 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GATA5Q9BWX5 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GATA5Q9BWX5 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GATA5Q9BWX5 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GATA5Q9BWX5 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GATA5Q9BWX5 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GATA5Q9BWX5 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GATA5Q9BWX5 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GATA5Q9BWX5 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GATA5Q9BWX5 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GATA5Q9BWX5 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GATA5Q9BWX5 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GATA5Q9BWX5 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GATA5Q9BWX5 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GATA5Q9BWX5 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GATA5Q9BWX5 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GATA5Q9BWX5 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GATA5Q9BWX5 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GATA5Q9BWX5 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GATA5Q9BWX5 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GATA5Q9BWX5 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GATA5Q9BWX5 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GATA5Q9BWX5 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GATA5Q9BWX5 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GATA5Q9BWX5 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GATA5Q9BWX5 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GATA5Q9BWX5 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GATA5Q9BWX5 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GATA5Q9BWX5 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GATA5Q9BWX5 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GATA5Q9BWX5 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GATA5Q9BWX5 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GATA5Q9BWX5 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GATA5Q9BWX5 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GATA5Q9BWX5 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GATA5Q9BWX5 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GATA5Q9BWX5 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GATA5Q9BWX5 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GATA5Q9BWX5 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GATA5Q9BWX5 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
GATA5Q9BWX5 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GATA5Q9BWX5 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GATA5Q9BWX5 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GATA5Q9BWX5 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GATA5Q9BWX5 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GATA5Q9BWX5 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GATA5Q9BWX5 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GATA5Q9BWX5 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GATA5Q9BWX5 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GATA5Q9BWX5 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GATA5Q9BWX5 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GATA5Q9BWX5 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GATA5Q9BWX5 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GATA5Q9BWX5 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GATA5Q9BWX5 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GATA5Q9BWX5 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GATA5Q9BWX5 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GATA5Q9BWX5 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GATA5Q9BWX5 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GATA5Q9BWX5 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GATA5Q9BWX5 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GATA5Q9BWX5 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GATA5Q9BWX5 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GATA5Q9BWX5 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GATA5Q9BWX5 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GATA5Q9BWX5 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GATA5Q9BWX5 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GATA5Q9BWX5 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GATA5Q9BWX5 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GATA5Q9BWX5 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GATA5Q9BWX5 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GATA5Q9BWX5 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GATA5Q9BWX5 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GATA5Q9BWX5 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GATA5Q9BWX5 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms