Protein–RNA interactions for Protein: Q96QD8

SLC38A2, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A2Q96QD8 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC38A2Q96QD8 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC38A2Q96QD8 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC38A2Q96QD8 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC38A2Q96QD8 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC38A2Q96QD8 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC38A2Q96QD8 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC38A2Q96QD8 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC38A2Q96QD8 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC38A2Q96QD8 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC38A2Q96QD8 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC38A2Q96QD8 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC38A2Q96QD8 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC38A2Q96QD8 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC38A2Q96QD8 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC38A2Q96QD8 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC38A2Q96QD8 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC38A2Q96QD8 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC38A2Q96QD8 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC38A2Q96QD8 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC38A2Q96QD8 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC38A2Q96QD8 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC38A2Q96QD8 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC38A2Q96QD8 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC38A2Q96QD8 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC38A2Q96QD8 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC38A2Q96QD8 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC38A2Q96QD8 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC38A2Q96QD8 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC38A2Q96QD8 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC38A2Q96QD8 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC38A2Q96QD8 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC38A2Q96QD8 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC38A2Q96QD8 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC38A2Q96QD8 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC38A2Q96QD8 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC38A2Q96QD8 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC38A2Q96QD8 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC38A2Q96QD8 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC38A2Q96QD8 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC38A2Q96QD8 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC38A2Q96QD8 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC38A2Q96QD8 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC38A2Q96QD8 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC38A2Q96QD8 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC38A2Q96QD8 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC38A2Q96QD8 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC38A2Q96QD8 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC38A2Q96QD8 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC38A2Q96QD8 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC38A2Q96QD8 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC38A2Q96QD8 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC38A2Q96QD8 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC38A2Q96QD8 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC38A2Q96QD8 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC38A2Q96QD8 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC38A2Q96QD8 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC38A2Q96QD8 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC38A2Q96QD8 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC38A2Q96QD8 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC38A2Q96QD8 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC38A2Q96QD8 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC38A2Q96QD8 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC38A2Q96QD8 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC38A2Q96QD8 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC38A2Q96QD8 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC38A2Q96QD8 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC38A2Q96QD8 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC38A2Q96QD8 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC38A2Q96QD8 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC38A2Q96QD8 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC38A2Q96QD8 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC38A2Q96QD8 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC38A2Q96QD8 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC38A2Q96QD8 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC38A2Q96QD8 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC38A2Q96QD8 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC38A2Q96QD8 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC38A2Q96QD8 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC38A2Q96QD8 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC38A2Q96QD8 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC38A2Q96QD8 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC38A2Q96QD8 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC38A2Q96QD8 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC38A2Q96QD8 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC38A2Q96QD8 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC38A2Q96QD8 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC38A2Q96QD8 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC38A2Q96QD8 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC38A2Q96QD8 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC38A2Q96QD8 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC38A2Q96QD8 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC38A2Q96QD8 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC38A2Q96QD8 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC38A2Q96QD8 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC38A2Q96QD8 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC38A2Q96QD8 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC38A2Q96QD8 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC38A2Q96QD8 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC38A2Q96QD8 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.9 ms