Protein–RNA interactions for Protein: Q96P20

NLRP3, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP3Q96P20 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NLRP3Q96P20 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NLRP3Q96P20 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NLRP3Q96P20 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NLRP3Q96P20 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NLRP3Q96P20 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NLRP3Q96P20 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
NLRP3Q96P20 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NLRP3Q96P20 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NLRP3Q96P20 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NLRP3Q96P20 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NLRP3Q96P20 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NLRP3Q96P20 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NLRP3Q96P20 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NLRP3Q96P20 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NLRP3Q96P20 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NLRP3Q96P20 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
NLRP3Q96P20 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
NLRP3Q96P20 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
NLRP3Q96P20 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NLRP3Q96P20 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NLRP3Q96P20 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NLRP3Q96P20 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NLRP3Q96P20 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NLRP3Q96P20 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NLRP3Q96P20 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NLRP3Q96P20 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NLRP3Q96P20 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NLRP3Q96P20 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NLRP3Q96P20 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NLRP3Q96P20 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NLRP3Q96P20 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NLRP3Q96P20 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NLRP3Q96P20 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
NLRP3Q96P20 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NLRP3Q96P20 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NLRP3Q96P20 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NLRP3Q96P20 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NLRP3Q96P20 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NLRP3Q96P20 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NLRP3Q96P20 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NLRP3Q96P20 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NLRP3Q96P20 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NLRP3Q96P20 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NLRP3Q96P20 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NLRP3Q96P20 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NLRP3Q96P20 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NLRP3Q96P20 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NLRP3Q96P20 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NLRP3Q96P20 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NLRP3Q96P20 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NLRP3Q96P20 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NLRP3Q96P20 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NLRP3Q96P20 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NLRP3Q96P20 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NLRP3Q96P20 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NLRP3Q96P20 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NLRP3Q96P20 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NLRP3Q96P20 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
NLRP3Q96P20 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NLRP3Q96P20 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NLRP3Q96P20 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NLRP3Q96P20 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NLRP3Q96P20 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
NLRP3Q96P20 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NLRP3Q96P20 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NLRP3Q96P20 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NLRP3Q96P20 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NLRP3Q96P20 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NLRP3Q96P20 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NLRP3Q96P20 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NLRP3Q96P20 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NLRP3Q96P20 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NLRP3Q96P20 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NLRP3Q96P20 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NLRP3Q96P20 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NLRP3Q96P20 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NLRP3Q96P20 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NLRP3Q96P20 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NLRP3Q96P20 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NLRP3Q96P20 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NLRP3Q96P20 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
NLRP3Q96P20 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NLRP3Q96P20 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NLRP3Q96P20 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NLRP3Q96P20 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NLRP3Q96P20 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NLRP3Q96P20 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NLRP3Q96P20 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NLRP3Q96P20 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NLRP3Q96P20 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
NLRP3Q96P20 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
NLRP3Q96P20 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
NLRP3Q96P20 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NLRP3Q96P20 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NLRP3Q96P20 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NLRP3Q96P20 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
NLRP3Q96P20 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NLRP3Q96P20 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NLRP3Q96P20 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms