Protein–RNA interactions for Protein: Q96JN0

LCOR, Ligand-dependent corepressor, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCORQ96JN0 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LCORQ96JN0 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LCORQ96JN0 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LCORQ96JN0 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LCORQ96JN0 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LCORQ96JN0 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LCORQ96JN0 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LCORQ96JN0 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LCORQ96JN0 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LCORQ96JN0 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LCORQ96JN0 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LCORQ96JN0 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LCORQ96JN0 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LCORQ96JN0 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LCORQ96JN0 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LCORQ96JN0 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LCORQ96JN0 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LCORQ96JN0 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LCORQ96JN0 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LCORQ96JN0 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LCORQ96JN0 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LCORQ96JN0 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LCORQ96JN0 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LCORQ96JN0 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LCORQ96JN0 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LCORQ96JN0 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LCORQ96JN0 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LCORQ96JN0 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LCORQ96JN0 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LCORQ96JN0 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LCORQ96JN0 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LCORQ96JN0 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LCORQ96JN0 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LCORQ96JN0 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LCORQ96JN0 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LCORQ96JN0 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LCORQ96JN0 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LCORQ96JN0 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LCORQ96JN0 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LCORQ96JN0 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LCORQ96JN0 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LCORQ96JN0 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LCORQ96JN0 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LCORQ96JN0 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LCORQ96JN0 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LCORQ96JN0 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LCORQ96JN0 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LCORQ96JN0 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LCORQ96JN0 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LCORQ96JN0 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LCORQ96JN0 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LCORQ96JN0 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LCORQ96JN0 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LCORQ96JN0 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LCORQ96JN0 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LCORQ96JN0 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LCORQ96JN0 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LCORQ96JN0 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LCORQ96JN0 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LCORQ96JN0 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LCORQ96JN0 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LCORQ96JN0 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LCORQ96JN0 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LCORQ96JN0 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LCORQ96JN0 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LCORQ96JN0 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LCORQ96JN0 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LCORQ96JN0 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LCORQ96JN0 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LCORQ96JN0 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LCORQ96JN0 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LCORQ96JN0 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LCORQ96JN0 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LCORQ96JN0 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LCORQ96JN0 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LCORQ96JN0 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LCORQ96JN0 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LCORQ96JN0 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LCORQ96JN0 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LCORQ96JN0 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LCORQ96JN0 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LCORQ96JN0 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LCORQ96JN0 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LCORQ96JN0 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LCORQ96JN0 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LCORQ96JN0 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LCORQ96JN0 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LCORQ96JN0 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LCORQ96JN0 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LCORQ96JN0 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LCORQ96JN0 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LCORQ96JN0 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LCORQ96JN0 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LCORQ96JN0 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LCORQ96JN0 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LCORQ96JN0 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LCORQ96JN0 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LCORQ96JN0 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LCORQ96JN0 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LCORQ96JN0 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms