Protein–RNA interactions for Protein: Q969T4

UBE2E3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E3, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E3Q969T4 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBE2E3Q969T4 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBE2E3Q969T4 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
UBE2E3Q969T4 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBE2E3Q969T4 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBE2E3Q969T4 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
UBE2E3Q969T4 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
UBE2E3Q969T4 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBE2E3Q969T4 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBE2E3Q969T4 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBE2E3Q969T4 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBE2E3Q969T4 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBE2E3Q969T4 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBE2E3Q969T4 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBE2E3Q969T4 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
UBE2E3Q969T4 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBE2E3Q969T4 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBE2E3Q969T4 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBE2E3Q969T4 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBE2E3Q969T4 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBE2E3Q969T4 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBE2E3Q969T4 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBE2E3Q969T4 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
UBE2E3Q969T4 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBE2E3Q969T4 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBE2E3Q969T4 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBE2E3Q969T4 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBE2E3Q969T4 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBE2E3Q969T4 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBE2E3Q969T4 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBE2E3Q969T4 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBE2E3Q969T4 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBE2E3Q969T4 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBE2E3Q969T4 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBE2E3Q969T4 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBE2E3Q969T4 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBE2E3Q969T4 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBE2E3Q969T4 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBE2E3Q969T4 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBE2E3Q969T4 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBE2E3Q969T4 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBE2E3Q969T4 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
UBE2E3Q969T4 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBE2E3Q969T4 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBE2E3Q969T4 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBE2E3Q969T4 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBE2E3Q969T4 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBE2E3Q969T4 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBE2E3Q969T4 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
UBE2E3Q969T4 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBE2E3Q969T4 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBE2E3Q969T4 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBE2E3Q969T4 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBE2E3Q969T4 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBE2E3Q969T4 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBE2E3Q969T4 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBE2E3Q969T4 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBE2E3Q969T4 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBE2E3Q969T4 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBE2E3Q969T4 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBE2E3Q969T4 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBE2E3Q969T4 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBE2E3Q969T4 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
UBE2E3Q969T4 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBE2E3Q969T4 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBE2E3Q969T4 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBE2E3Q969T4 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBE2E3Q969T4 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBE2E3Q969T4 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBE2E3Q969T4 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBE2E3Q969T4 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBE2E3Q969T4 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBE2E3Q969T4 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBE2E3Q969T4 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
UBE2E3Q969T4 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBE2E3Q969T4 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBE2E3Q969T4 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBE2E3Q969T4 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBE2E3Q969T4 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBE2E3Q969T4 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBE2E3Q969T4 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBE2E3Q969T4 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
UBE2E3Q969T4 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBE2E3Q969T4 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBE2E3Q969T4 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBE2E3Q969T4 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
UBE2E3Q969T4 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBE2E3Q969T4 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBE2E3Q969T4 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
UBE2E3Q969T4 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBE2E3Q969T4 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBE2E3Q969T4 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
UBE2E3Q969T4 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBE2E3Q969T4 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
UBE2E3Q969T4 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBE2E3Q969T4 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBE2E3Q969T4 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBE2E3Q969T4 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBE2E3Q969T4 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBE2E3Q969T4 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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