Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDP4

ZNF439, Zinc finger protein 439, humanhuman

Predictions only

Length 499 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF439Q8NDP4 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
ZNF439Q8NDP4 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ZNF439Q8NDP4 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ZNF439Q8NDP4 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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ZNF439Q8NDP4 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ZNF439Q8NDP4 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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ZNF439Q8NDP4 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ZNF439Q8NDP4 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ZNF439Q8NDP4 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ZNF439Q8NDP4 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ZNF439Q8NDP4 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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ZNF439Q8NDP4 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ZNF439Q8NDP4 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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ZNF439Q8NDP4 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ZNF439Q8NDP4 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ZNF439Q8NDP4 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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ZNF439Q8NDP4 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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ZNF439Q8NDP4 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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ZNF439Q8NDP4 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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ZNF439Q8NDP4 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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ZNF439Q8NDP4 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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ZNF439Q8NDP4 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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ZNF439Q8NDP4 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
ZNF439Q8NDP4 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
ZNF439Q8NDP4 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
ZNF439Q8NDP4 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
ZNF439Q8NDP4 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
ZNF439Q8NDP4 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC13.87□□□□□ -0.19
ZNF439Q8NDP4 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
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ZNF439Q8NDP4 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC13.87□□□□□ -0.19
ZNF439Q8NDP4 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
ZNF439Q8NDP4 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
ZNF439Q8NDP4 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ZNF439Q8NDP4 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
ZNF439Q8NDP4 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ZNF439Q8NDP4 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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