Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9W8

FAM71D, Protein FAM71D, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM71DQ8N9W8 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM71DQ8N9W8 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM71DQ8N9W8 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM71DQ8N9W8 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM71DQ8N9W8 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM71DQ8N9W8 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM71DQ8N9W8 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM71DQ8N9W8 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM71DQ8N9W8 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM71DQ8N9W8 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM71DQ8N9W8 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM71DQ8N9W8 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM71DQ8N9W8 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM71DQ8N9W8 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM71DQ8N9W8 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM71DQ8N9W8 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM71DQ8N9W8 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM71DQ8N9W8 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM71DQ8N9W8 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM71DQ8N9W8 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM71DQ8N9W8 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM71DQ8N9W8 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM71DQ8N9W8 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM71DQ8N9W8 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM71DQ8N9W8 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM71DQ8N9W8 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM71DQ8N9W8 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM71DQ8N9W8 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM71DQ8N9W8 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM71DQ8N9W8 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM71DQ8N9W8 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM71DQ8N9W8 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM71DQ8N9W8 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM71DQ8N9W8 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM71DQ8N9W8 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM71DQ8N9W8 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM71DQ8N9W8 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM71DQ8N9W8 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM71DQ8N9W8 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM71DQ8N9W8 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM71DQ8N9W8 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM71DQ8N9W8 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM71DQ8N9W8 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM71DQ8N9W8 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM71DQ8N9W8 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM71DQ8N9W8 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM71DQ8N9W8 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM71DQ8N9W8 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM71DQ8N9W8 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM71DQ8N9W8 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM71DQ8N9W8 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM71DQ8N9W8 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM71DQ8N9W8 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM71DQ8N9W8 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM71DQ8N9W8 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM71DQ8N9W8 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM71DQ8N9W8 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM71DQ8N9W8 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM71DQ8N9W8 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM71DQ8N9W8 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM71DQ8N9W8 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM71DQ8N9W8 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM71DQ8N9W8 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM71DQ8N9W8 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM71DQ8N9W8 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM71DQ8N9W8 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM71DQ8N9W8 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM71DQ8N9W8 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM71DQ8N9W8 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM71DQ8N9W8 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM71DQ8N9W8 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM71DQ8N9W8 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM71DQ8N9W8 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM71DQ8N9W8 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM71DQ8N9W8 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM71DQ8N9W8 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM71DQ8N9W8 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM71DQ8N9W8 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM71DQ8N9W8 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM71DQ8N9W8 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM71DQ8N9W8 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM71DQ8N9W8 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM71DQ8N9W8 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM71DQ8N9W8 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM71DQ8N9W8 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM71DQ8N9W8 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM71DQ8N9W8 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM71DQ8N9W8 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM71DQ8N9W8 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM71DQ8N9W8 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM71DQ8N9W8 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM71DQ8N9W8 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM71DQ8N9W8 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM71DQ8N9W8 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM71DQ8N9W8 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM71DQ8N9W8 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM71DQ8N9W8 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM71DQ8N9W8 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM71DQ8N9W8 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM71DQ8N9W8 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms