Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6F1

CLDN19, Claudin-19, humanhuman

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN19Q8N6F1 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLDN19Q8N6F1 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLDN19Q8N6F1 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLDN19Q8N6F1 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLDN19Q8N6F1 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLDN19Q8N6F1 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLDN19Q8N6F1 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLDN19Q8N6F1 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLDN19Q8N6F1 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLDN19Q8N6F1 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLDN19Q8N6F1 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLDN19Q8N6F1 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CLDN19Q8N6F1 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLDN19Q8N6F1 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLDN19Q8N6F1 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLDN19Q8N6F1 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLDN19Q8N6F1 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLDN19Q8N6F1 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLDN19Q8N6F1 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLDN19Q8N6F1 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLDN19Q8N6F1 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLDN19Q8N6F1 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CLDN19Q8N6F1 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLDN19Q8N6F1 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLDN19Q8N6F1 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLDN19Q8N6F1 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CLDN19Q8N6F1 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLDN19Q8N6F1 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLDN19Q8N6F1 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLDN19Q8N6F1 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLDN19Q8N6F1 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLDN19Q8N6F1 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLDN19Q8N6F1 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLDN19Q8N6F1 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLDN19Q8N6F1 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLDN19Q8N6F1 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CLDN19Q8N6F1 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLDN19Q8N6F1 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLDN19Q8N6F1 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLDN19Q8N6F1 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLDN19Q8N6F1 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN19Q8N6F1 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN19Q8N6F1 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN19Q8N6F1 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN19Q8N6F1 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
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CLDN19Q8N6F1 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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CLDN19Q8N6F1 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN19Q8N6F1 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN19Q8N6F1 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN19Q8N6F1 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN19Q8N6F1 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN19Q8N6F1 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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CLDN19Q8N6F1 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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CLDN19Q8N6F1 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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CLDN19Q8N6F1 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN19Q8N6F1 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN19Q8N6F1 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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CLDN19Q8N6F1 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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CLDN19Q8N6F1 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN19Q8N6F1 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN19Q8N6F1 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN19Q8N6F1 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN19Q8N6F1 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN19Q8N6F1 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN19Q8N6F1 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLDN19Q8N6F1 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLDN19Q8N6F1 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLDN19Q8N6F1 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLDN19Q8N6F1 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLDN19Q8N6F1 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLDN19Q8N6F1 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLDN19Q8N6F1 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLDN19Q8N6F1 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLDN19Q8N6F1 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLDN19Q8N6F1 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLDN19Q8N6F1 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CLDN19Q8N6F1 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLDN19Q8N6F1 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLDN19Q8N6F1 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLDN19Q8N6F1 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLDN19Q8N6F1 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLDN19Q8N6F1 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLDN19Q8N6F1 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
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