Protein–RNA interactions for Protein: Q8N474

SFRP1, Secreted frizzled-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFRP1Q8N474 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SFRP1Q8N474 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SFRP1Q8N474 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SFRP1Q8N474 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SFRP1Q8N474 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SFRP1Q8N474 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SFRP1Q8N474 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SFRP1Q8N474 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SFRP1Q8N474 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SFRP1Q8N474 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
SFRP1Q8N474 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
SFRP1Q8N474 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SFRP1Q8N474 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SFRP1Q8N474 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SFRP1Q8N474 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
SFRP1Q8N474 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SFRP1Q8N474 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SFRP1Q8N474 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SFRP1Q8N474 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SFRP1Q8N474 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SFRP1Q8N474 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SFRP1Q8N474 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SFRP1Q8N474 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SFRP1Q8N474 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SFRP1Q8N474 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SFRP1Q8N474 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SFRP1Q8N474 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SFRP1Q8N474 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SFRP1Q8N474 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SFRP1Q8N474 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SFRP1Q8N474 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SFRP1Q8N474 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SFRP1Q8N474 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SFRP1Q8N474 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SFRP1Q8N474 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SFRP1Q8N474 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SFRP1Q8N474 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SFRP1Q8N474 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SFRP1Q8N474 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SFRP1Q8N474 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SFRP1Q8N474 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SFRP1Q8N474 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SFRP1Q8N474 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SFRP1Q8N474 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SFRP1Q8N474 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SFRP1Q8N474 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SFRP1Q8N474 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SFRP1Q8N474 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SFRP1Q8N474 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SFRP1Q8N474 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SFRP1Q8N474 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SFRP1Q8N474 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SFRP1Q8N474 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SFRP1Q8N474 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SFRP1Q8N474 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SFRP1Q8N474 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SFRP1Q8N474 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SFRP1Q8N474 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SFRP1Q8N474 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SFRP1Q8N474 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SFRP1Q8N474 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SFRP1Q8N474 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SFRP1Q8N474 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SFRP1Q8N474 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SFRP1Q8N474 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SFRP1Q8N474 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SFRP1Q8N474 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SFRP1Q8N474 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SFRP1Q8N474 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SFRP1Q8N474 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SFRP1Q8N474 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SFRP1Q8N474 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SFRP1Q8N474 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SFRP1Q8N474 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SFRP1Q8N474 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SFRP1Q8N474 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SFRP1Q8N474 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SFRP1Q8N474 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SFRP1Q8N474 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SFRP1Q8N474 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SFRP1Q8N474 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SFRP1Q8N474 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SFRP1Q8N474 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SFRP1Q8N474 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SFRP1Q8N474 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SFRP1Q8N474 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SFRP1Q8N474 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SFRP1Q8N474 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SFRP1Q8N474 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SFRP1Q8N474 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SFRP1Q8N474 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SFRP1Q8N474 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SFRP1Q8N474 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SFRP1Q8N474 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SFRP1Q8N474 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SFRP1Q8N474 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SFRP1Q8N474 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SFRP1Q8N474 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SFRP1Q8N474 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SFRP1Q8N474 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.4 ms