Protein–RNA interactions for Protein: Q8N1M1

BEST3, Bestrophin-3, humanhuman

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Length 668 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEST3Q8N1M1 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BEST3Q8N1M1 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BEST3Q8N1M1 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BEST3Q8N1M1 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BEST3Q8N1M1 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BEST3Q8N1M1 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BEST3Q8N1M1 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BEST3Q8N1M1 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
BEST3Q8N1M1 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BEST3Q8N1M1 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
BEST3Q8N1M1 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BEST3Q8N1M1 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BEST3Q8N1M1 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
BEST3Q8N1M1 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BEST3Q8N1M1 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BEST3Q8N1M1 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BEST3Q8N1M1 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
BEST3Q8N1M1 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
BEST3Q8N1M1 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
BEST3Q8N1M1 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
BEST3Q8N1M1 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
BEST3Q8N1M1 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BEST3Q8N1M1 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BEST3Q8N1M1 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BEST3Q8N1M1 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BEST3Q8N1M1 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BEST3Q8N1M1 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BEST3Q8N1M1 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BEST3Q8N1M1 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BEST3Q8N1M1 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BEST3Q8N1M1 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BEST3Q8N1M1 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BEST3Q8N1M1 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BEST3Q8N1M1 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
BEST3Q8N1M1 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BEST3Q8N1M1 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
BEST3Q8N1M1 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BEST3Q8N1M1 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BEST3Q8N1M1 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BEST3Q8N1M1 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BEST3Q8N1M1 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BEST3Q8N1M1 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BEST3Q8N1M1 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BEST3Q8N1M1 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BEST3Q8N1M1 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BEST3Q8N1M1 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
BEST3Q8N1M1 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BEST3Q8N1M1 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BEST3Q8N1M1 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BEST3Q8N1M1 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BEST3Q8N1M1 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BEST3Q8N1M1 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BEST3Q8N1M1 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BEST3Q8N1M1 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BEST3Q8N1M1 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BEST3Q8N1M1 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
BEST3Q8N1M1 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
BEST3Q8N1M1 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BEST3Q8N1M1 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
BEST3Q8N1M1 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BEST3Q8N1M1 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BEST3Q8N1M1 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BEST3Q8N1M1 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
BEST3Q8N1M1 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
BEST3Q8N1M1 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BEST3Q8N1M1 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BEST3Q8N1M1 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BEST3Q8N1M1 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BEST3Q8N1M1 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BEST3Q8N1M1 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BEST3Q8N1M1 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
BEST3Q8N1M1 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BEST3Q8N1M1 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BEST3Q8N1M1 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BEST3Q8N1M1 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BEST3Q8N1M1 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BEST3Q8N1M1 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BEST3Q8N1M1 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BEST3Q8N1M1 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BEST3Q8N1M1 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BEST3Q8N1M1 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BEST3Q8N1M1 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BEST3Q8N1M1 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BEST3Q8N1M1 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BEST3Q8N1M1 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BEST3Q8N1M1 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BEST3Q8N1M1 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BEST3Q8N1M1 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BEST3Q8N1M1 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BEST3Q8N1M1 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BEST3Q8N1M1 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BEST3Q8N1M1 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BEST3Q8N1M1 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BEST3Q8N1M1 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BEST3Q8N1M1 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BEST3Q8N1M1 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BEST3Q8N1M1 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BEST3Q8N1M1 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BEST3Q8N1M1 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BEST3Q8N1M1 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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