Protein–RNA interactions for Protein: Q76B58

BRINP3, BMP/retinoic acid-inducible neural-specific protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRINP3Q76B58 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BRINP3Q76B58 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
BRINP3Q76B58 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BRINP3Q76B58 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BRINP3Q76B58 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
BRINP3Q76B58 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
BRINP3Q76B58 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BRINP3Q76B58 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BRINP3Q76B58 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BRINP3Q76B58 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BRINP3Q76B58 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BRINP3Q76B58 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BRINP3Q76B58 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BRINP3Q76B58 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BRINP3Q76B58 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BRINP3Q76B58 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BRINP3Q76B58 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BRINP3Q76B58 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BRINP3Q76B58 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BRINP3Q76B58 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
BRINP3Q76B58 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BRINP3Q76B58 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BRINP3Q76B58 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BRINP3Q76B58 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BRINP3Q76B58 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BRINP3Q76B58 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BRINP3Q76B58 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
BRINP3Q76B58 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BRINP3Q76B58 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
BRINP3Q76B58 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BRINP3Q76B58 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
BRINP3Q76B58 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BRINP3Q76B58 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BRINP3Q76B58 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BRINP3Q76B58 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BRINP3Q76B58 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BRINP3Q76B58 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
BRINP3Q76B58 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BRINP3Q76B58 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BRINP3Q76B58 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BRINP3Q76B58 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BRINP3Q76B58 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BRINP3Q76B58 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
BRINP3Q76B58 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BRINP3Q76B58 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BRINP3Q76B58 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BRINP3Q76B58 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BRINP3Q76B58 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BRINP3Q76B58 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BRINP3Q76B58 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BRINP3Q76B58 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BRINP3Q76B58 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BRINP3Q76B58 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BRINP3Q76B58 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BRINP3Q76B58 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BRINP3Q76B58 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
BRINP3Q76B58 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BRINP3Q76B58 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BRINP3Q76B58 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
BRINP3Q76B58 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BRINP3Q76B58 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
BRINP3Q76B58 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BRINP3Q76B58 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BRINP3Q76B58 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BRINP3Q76B58 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BRINP3Q76B58 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BRINP3Q76B58 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BRINP3Q76B58 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BRINP3Q76B58 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BRINP3Q76B58 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BRINP3Q76B58 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BRINP3Q76B58 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BRINP3Q76B58 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BRINP3Q76B58 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BRINP3Q76B58 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BRINP3Q76B58 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BRINP3Q76B58 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BRINP3Q76B58 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BRINP3Q76B58 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BRINP3Q76B58 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BRINP3Q76B58 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BRINP3Q76B58 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
BRINP3Q76B58 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
BRINP3Q76B58 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BRINP3Q76B58 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BRINP3Q76B58 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BRINP3Q76B58 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BRINP3Q76B58 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BRINP3Q76B58 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BRINP3Q76B58 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
BRINP3Q76B58 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
BRINP3Q76B58 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
BRINP3Q76B58 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BRINP3Q76B58 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
BRINP3Q76B58 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BRINP3Q76B58 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BRINP3Q76B58 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BRINP3Q76B58 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BRINP3Q76B58 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BRINP3Q76B58 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms