Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT1

ANKRD54, Ankyrin repeat domain-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54Q6NXT1 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ANKRD54Q6NXT1 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ANKRD54Q6NXT1 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ANKRD54Q6NXT1 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ANKRD54Q6NXT1 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ANKRD54Q6NXT1 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ANKRD54Q6NXT1 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ANKRD54Q6NXT1 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ANKRD54Q6NXT1 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ANKRD54Q6NXT1 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ANKRD54Q6NXT1 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ANKRD54Q6NXT1 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ANKRD54Q6NXT1 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ANKRD54Q6NXT1 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ANKRD54Q6NXT1 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ANKRD54Q6NXT1 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ANKRD54Q6NXT1 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ANKRD54Q6NXT1 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ANKRD54Q6NXT1 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ANKRD54Q6NXT1 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ANKRD54Q6NXT1 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ANKRD54Q6NXT1 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ANKRD54Q6NXT1 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ANKRD54Q6NXT1 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ANKRD54Q6NXT1 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ANKRD54Q6NXT1 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ANKRD54Q6NXT1 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ANKRD54Q6NXT1 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ANKRD54Q6NXT1 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ANKRD54Q6NXT1 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ANKRD54Q6NXT1 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ANKRD54Q6NXT1 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ANKRD54Q6NXT1 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ANKRD54Q6NXT1 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ANKRD54Q6NXT1 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ANKRD54Q6NXT1 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ANKRD54Q6NXT1 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ANKRD54Q6NXT1 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ANKRD54Q6NXT1 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ANKRD54Q6NXT1 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ANKRD54Q6NXT1 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ANKRD54Q6NXT1 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ANKRD54Q6NXT1 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ANKRD54Q6NXT1 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ANKRD54Q6NXT1 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ANKRD54Q6NXT1 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ANKRD54Q6NXT1 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ANKRD54Q6NXT1 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ANKRD54Q6NXT1 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ANKRD54Q6NXT1 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ANKRD54Q6NXT1 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ANKRD54Q6NXT1 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ANKRD54Q6NXT1 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ANKRD54Q6NXT1 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ANKRD54Q6NXT1 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ANKRD54Q6NXT1 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ANKRD54Q6NXT1 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ANKRD54Q6NXT1 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ANKRD54Q6NXT1 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ANKRD54Q6NXT1 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ANKRD54Q6NXT1 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ANKRD54Q6NXT1 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ANKRD54Q6NXT1 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ANKRD54Q6NXT1 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ANKRD54Q6NXT1 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ANKRD54Q6NXT1 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ANKRD54Q6NXT1 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ANKRD54Q6NXT1 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ANKRD54Q6NXT1 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ANKRD54Q6NXT1 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ANKRD54Q6NXT1 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ANKRD54Q6NXT1 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ANKRD54Q6NXT1 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ANKRD54Q6NXT1 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ANKRD54Q6NXT1 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ANKRD54Q6NXT1 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ANKRD54Q6NXT1 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ANKRD54Q6NXT1 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ANKRD54Q6NXT1 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ANKRD54Q6NXT1 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ANKRD54Q6NXT1 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ANKRD54Q6NXT1 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ANKRD54Q6NXT1 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
ANKRD54Q6NXT1 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
ANKRD54Q6NXT1 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ANKRD54Q6NXT1 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ANKRD54Q6NXT1 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ANKRD54Q6NXT1 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ANKRD54Q6NXT1 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ANKRD54Q6NXT1 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ANKRD54Q6NXT1 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ANKRD54Q6NXT1 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ANKRD54Q6NXT1 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ANKRD54Q6NXT1 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ANKRD54Q6NXT1 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ANKRD54Q6NXT1 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ANKRD54Q6NXT1 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ANKRD54Q6NXT1 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ANKRD54Q6NXT1 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ANKRD54Q6NXT1 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms