Protein–RNA interactions for Protein: Q6IPR3

TYW3, tRNA wybutosine-synthesizing protein 3 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TYW3Q6IPR3 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TYW3Q6IPR3 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TYW3Q6IPR3 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TYW3Q6IPR3 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TYW3Q6IPR3 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TYW3Q6IPR3 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TYW3Q6IPR3 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TYW3Q6IPR3 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TYW3Q6IPR3 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TYW3Q6IPR3 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TYW3Q6IPR3 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TYW3Q6IPR3 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TYW3Q6IPR3 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TYW3Q6IPR3 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TYW3Q6IPR3 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TYW3Q6IPR3 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TYW3Q6IPR3 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TYW3Q6IPR3 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TYW3Q6IPR3 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TYW3Q6IPR3 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TYW3Q6IPR3 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TYW3Q6IPR3 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TYW3Q6IPR3 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TYW3Q6IPR3 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TYW3Q6IPR3 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TYW3Q6IPR3 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TYW3Q6IPR3 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TYW3Q6IPR3 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TYW3Q6IPR3 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TYW3Q6IPR3 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TYW3Q6IPR3 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TYW3Q6IPR3 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TYW3Q6IPR3 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TYW3Q6IPR3 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TYW3Q6IPR3 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TYW3Q6IPR3 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TYW3Q6IPR3 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TYW3Q6IPR3 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TYW3Q6IPR3 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TYW3Q6IPR3 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TYW3Q6IPR3 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TYW3Q6IPR3 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TYW3Q6IPR3 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TYW3Q6IPR3 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TYW3Q6IPR3 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TYW3Q6IPR3 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TYW3Q6IPR3 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TYW3Q6IPR3 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TYW3Q6IPR3 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TYW3Q6IPR3 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TYW3Q6IPR3 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TYW3Q6IPR3 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TYW3Q6IPR3 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TYW3Q6IPR3 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TYW3Q6IPR3 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TYW3Q6IPR3 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TYW3Q6IPR3 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TYW3Q6IPR3 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TYW3Q6IPR3 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TYW3Q6IPR3 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TYW3Q6IPR3 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TYW3Q6IPR3 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TYW3Q6IPR3 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TYW3Q6IPR3 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TYW3Q6IPR3 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TYW3Q6IPR3 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TYW3Q6IPR3 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TYW3Q6IPR3 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TYW3Q6IPR3 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TYW3Q6IPR3 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TYW3Q6IPR3 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TYW3Q6IPR3 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TYW3Q6IPR3 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TYW3Q6IPR3 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TYW3Q6IPR3 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TYW3Q6IPR3 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TYW3Q6IPR3 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TYW3Q6IPR3 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TYW3Q6IPR3 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TYW3Q6IPR3 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TYW3Q6IPR3 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TYW3Q6IPR3 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TYW3Q6IPR3 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TYW3Q6IPR3 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TYW3Q6IPR3 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TYW3Q6IPR3 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TYW3Q6IPR3 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TYW3Q6IPR3 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TYW3Q6IPR3 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TYW3Q6IPR3 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TYW3Q6IPR3 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TYW3Q6IPR3 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TYW3Q6IPR3 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TYW3Q6IPR3 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TYW3Q6IPR3 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TYW3Q6IPR3 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TYW3Q6IPR3 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TYW3Q6IPR3 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TYW3Q6IPR3 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TYW3Q6IPR3 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms