Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWN6

FAM208B, Protein FAM208B, humanhuman

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Length 2,430 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM208BQ5VWN6 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
FAM208BQ5VWN6 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
FAM208BQ5VWN6 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
FAM208BQ5VWN6 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
FAM208BQ5VWN6 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
FAM208BQ5VWN6 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
FAM208BQ5VWN6 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
FAM208BQ5VWN6 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
FAM208BQ5VWN6 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
FAM208BQ5VWN6 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
FAM208BQ5VWN6 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
FAM208BQ5VWN6 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
FAM208BQ5VWN6 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
FAM208BQ5VWN6 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
FAM208BQ5VWN6 SIAH2-AS1-201ENST00000461943 441 ntTSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
FAM208BQ5VWN6 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
FAM208BQ5VWN6 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
FAM208BQ5VWN6 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
FAM208BQ5VWN6 UXT-AS1-202ENST00000591832 565 ntTSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
FAM208BQ5VWN6 AC011462.2-201ENST00000598887 344 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
FAM208BQ5VWN6 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
FAM208BQ5VWN6 AC009084.3-201ENST00000623356 437 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
FAM208BQ5VWN6 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
FAM208BQ5VWN6 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
FAM208BQ5VWN6 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
FAM208BQ5VWN6 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
FAM208BQ5VWN6 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
FAM208BQ5VWN6 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
FAM208BQ5VWN6 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
FAM208BQ5VWN6 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
FAM208BQ5VWN6 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
FAM208BQ5VWN6 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
FAM208BQ5VWN6 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
FAM208BQ5VWN6 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
FAM208BQ5VWN6 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
FAM208BQ5VWN6 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
FAM208BQ5VWN6 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
FAM208BQ5VWN6 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
FAM208BQ5VWN6 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
FAM208BQ5VWN6 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
FAM208BQ5VWN6 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
FAM208BQ5VWN6 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
FAM208BQ5VWN6 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
FAM208BQ5VWN6 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
FAM208BQ5VWN6 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
FAM208BQ5VWN6 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
FAM208BQ5VWN6 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
FAM208BQ5VWN6 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
FAM208BQ5VWN6 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
FAM208BQ5VWN6 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
FAM208BQ5VWN6 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
FAM208BQ5VWN6 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
FAM208BQ5VWN6 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
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FAM208BQ5VWN6 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
FAM208BQ5VWN6 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
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FAM208BQ5VWN6 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
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FAM208BQ5VWN6 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
FAM208BQ5VWN6 AC009119.2-201ENST00000561562 723 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
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FAM208BQ5VWN6 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
FAM208BQ5VWN6 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
FAM208BQ5VWN6 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
FAM208BQ5VWN6 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
FAM208BQ5VWN6 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
FAM208BQ5VWN6 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
FAM208BQ5VWN6 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
FAM208BQ5VWN6 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
FAM208BQ5VWN6 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
FAM208BQ5VWN6 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
FAM208BQ5VWN6 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
FAM208BQ5VWN6 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
FAM208BQ5VWN6 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
FAM208BQ5VWN6 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
FAM208BQ5VWN6 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
FAM208BQ5VWN6 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
FAM208BQ5VWN6 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
FAM208BQ5VWN6 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
FAM208BQ5VWN6 ENDOV-229ENST00000523999 864 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
FAM208BQ5VWN6 ZSCAN10-205ENST00000572548 618 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
FAM208BQ5VWN6 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
FAM208BQ5VWN6 LINC00969-257ENST00000625632 898 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
FAM208BQ5VWN6 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
FAM208BQ5VWN6 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
FAM208BQ5VWN6 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
FAM208BQ5VWN6 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
FAM208BQ5VWN6 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FAM208BQ5VWN6 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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