Protein–RNA interactions for Protein: Q5VVW2

GARNL3, GTPase-activating Rap/Ran-GAP domain-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,013 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GARNL3Q5VVW2 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GARNL3Q5VVW2 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GARNL3Q5VVW2 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GARNL3Q5VVW2 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GARNL3Q5VVW2 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
GARNL3Q5VVW2 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
GARNL3Q5VVW2 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
GARNL3Q5VVW2 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GARNL3Q5VVW2 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GARNL3Q5VVW2 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GARNL3Q5VVW2 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GARNL3Q5VVW2 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GARNL3Q5VVW2 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GARNL3Q5VVW2 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GARNL3Q5VVW2 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GARNL3Q5VVW2 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GARNL3Q5VVW2 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GARNL3Q5VVW2 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GARNL3Q5VVW2 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GARNL3Q5VVW2 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GARNL3Q5VVW2 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GARNL3Q5VVW2 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GARNL3Q5VVW2 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GARNL3Q5VVW2 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GARNL3Q5VVW2 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GARNL3Q5VVW2 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
GARNL3Q5VVW2 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GARNL3Q5VVW2 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GARNL3Q5VVW2 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
GARNL3Q5VVW2 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GARNL3Q5VVW2 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GARNL3Q5VVW2 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GARNL3Q5VVW2 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GARNL3Q5VVW2 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GARNL3Q5VVW2 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
GARNL3Q5VVW2 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GARNL3Q5VVW2 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
GARNL3Q5VVW2 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GARNL3Q5VVW2 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GARNL3Q5VVW2 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GARNL3Q5VVW2 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
GARNL3Q5VVW2 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GARNL3Q5VVW2 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
GARNL3Q5VVW2 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
GARNL3Q5VVW2 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GARNL3Q5VVW2 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GARNL3Q5VVW2 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GARNL3Q5VVW2 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GARNL3Q5VVW2 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GARNL3Q5VVW2 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GARNL3Q5VVW2 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GARNL3Q5VVW2 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GARNL3Q5VVW2 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
GARNL3Q5VVW2 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GARNL3Q5VVW2 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GARNL3Q5VVW2 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GARNL3Q5VVW2 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GARNL3Q5VVW2 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GARNL3Q5VVW2 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GARNL3Q5VVW2 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GARNL3Q5VVW2 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GARNL3Q5VVW2 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GARNL3Q5VVW2 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GARNL3Q5VVW2 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GARNL3Q5VVW2 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GARNL3Q5VVW2 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GARNL3Q5VVW2 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GARNL3Q5VVW2 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GARNL3Q5VVW2 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GARNL3Q5VVW2 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GARNL3Q5VVW2 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GARNL3Q5VVW2 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
GARNL3Q5VVW2 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GARNL3Q5VVW2 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
GARNL3Q5VVW2 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GARNL3Q5VVW2 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GARNL3Q5VVW2 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GARNL3Q5VVW2 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GARNL3Q5VVW2 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GARNL3Q5VVW2 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GARNL3Q5VVW2 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
GARNL3Q5VVW2 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GARNL3Q5VVW2 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GARNL3Q5VVW2 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GARNL3Q5VVW2 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GARNL3Q5VVW2 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GARNL3Q5VVW2 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GARNL3Q5VVW2 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
GARNL3Q5VVW2 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GARNL3Q5VVW2 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GARNL3Q5VVW2 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GARNL3Q5VVW2 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GARNL3Q5VVW2 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GARNL3Q5VVW2 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GARNL3Q5VVW2 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GARNL3Q5VVW2 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GARNL3Q5VVW2 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GARNL3Q5VVW2 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GARNL3Q5VVW2 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GARNL3Q5VVW2 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms