Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,714 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
COL24A1Q17RW2 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
COL24A1Q17RW2 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
COL24A1Q17RW2 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
COL24A1Q17RW2 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
COL24A1Q17RW2 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
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COL24A1Q17RW2 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
COL24A1Q17RW2 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
COL24A1Q17RW2 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
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COL24A1Q17RW2 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
COL24A1Q17RW2 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
COL24A1Q17RW2 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
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COL24A1Q17RW2 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
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COL24A1Q17RW2 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
COL24A1Q17RW2 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
COL24A1Q17RW2 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
COL24A1Q17RW2 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
COL24A1Q17RW2 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
COL24A1Q17RW2 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
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COL24A1Q17RW2 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
COL24A1Q17RW2 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
COL24A1Q17RW2 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
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COL24A1Q17RW2 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
COL24A1Q17RW2 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
COL24A1Q17RW2 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
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COL24A1Q17RW2 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
COL24A1Q17RW2 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
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COL24A1Q17RW2 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
COL24A1Q17RW2 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
COL24A1Q17RW2 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
COL24A1Q17RW2 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
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COL24A1Q17RW2 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
COL24A1Q17RW2 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
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COL24A1Q17RW2 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
COL24A1Q17RW2 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
COL24A1Q17RW2 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
COL24A1Q17RW2 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
COL24A1Q17RW2 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
COL24A1Q17RW2 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
COL24A1Q17RW2 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
COL24A1Q17RW2 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
COL24A1Q17RW2 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
COL24A1Q17RW2 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
COL24A1Q17RW2 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
COL24A1Q17RW2 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
COL24A1Q17RW2 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
COL24A1Q17RW2 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
COL24A1Q17RW2 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
COL24A1Q17RW2 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
COL24A1Q17RW2 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
COL24A1Q17RW2 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
COL24A1Q17RW2 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
COL24A1Q17RW2 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
COL24A1Q17RW2 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
COL24A1Q17RW2 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
COL24A1Q17RW2 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
COL24A1Q17RW2 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
COL24A1Q17RW2 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
COL24A1Q17RW2 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
COL24A1Q17RW2 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
COL24A1Q17RW2 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
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