Protein–RNA interactions for Protein: Q16620

NTRK2, BDNF/NT-3 growth factors receptor, humanhuman

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Length 822 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK2Q16620 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
NTRK2Q16620 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NTRK2Q16620 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NTRK2Q16620 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NTRK2Q16620 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NTRK2Q16620 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NTRK2Q16620 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NTRK2Q16620 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NTRK2Q16620 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NTRK2Q16620 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NTRK2Q16620 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NTRK2Q16620 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NTRK2Q16620 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NTRK2Q16620 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NTRK2Q16620 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NTRK2Q16620 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NTRK2Q16620 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NTRK2Q16620 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NTRK2Q16620 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NTRK2Q16620 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NTRK2Q16620 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NTRK2Q16620 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NTRK2Q16620 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NTRK2Q16620 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NTRK2Q16620 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NTRK2Q16620 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NTRK2Q16620 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NTRK2Q16620 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NTRK2Q16620 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NTRK2Q16620 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NTRK2Q16620 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NTRK2Q16620 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NTRK2Q16620 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NTRK2Q16620 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NTRK2Q16620 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NTRK2Q16620 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NTRK2Q16620 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NTRK2Q16620 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NTRK2Q16620 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NTRK2Q16620 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NTRK2Q16620 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NTRK2Q16620 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NTRK2Q16620 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NTRK2Q16620 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NTRK2Q16620 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NTRK2Q16620 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NTRK2Q16620 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NTRK2Q16620 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NTRK2Q16620 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NTRK2Q16620 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NTRK2Q16620 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NTRK2Q16620 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NTRK2Q16620 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NTRK2Q16620 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NTRK2Q16620 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NTRK2Q16620 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NTRK2Q16620 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NTRK2Q16620 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NTRK2Q16620 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NTRK2Q16620 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NTRK2Q16620 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NTRK2Q16620 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NTRK2Q16620 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NTRK2Q16620 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NTRK2Q16620 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NTRK2Q16620 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NTRK2Q16620 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NTRK2Q16620 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NTRK2Q16620 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NTRK2Q16620 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
NTRK2Q16620 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
NTRK2Q16620 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NTRK2Q16620 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NTRK2Q16620 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NTRK2Q16620 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NTRK2Q16620 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
NTRK2Q16620 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NTRK2Q16620 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NTRK2Q16620 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
NTRK2Q16620 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NTRK2Q16620 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
NTRK2Q16620 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
NTRK2Q16620 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NTRK2Q16620 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NTRK2Q16620 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NTRK2Q16620 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NTRK2Q16620 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NTRK2Q16620 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NTRK2Q16620 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NTRK2Q16620 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NTRK2Q16620 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NTRK2Q16620 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NTRK2Q16620 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NTRK2Q16620 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NTRK2Q16620 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NTRK2Q16620 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
NTRK2Q16620 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NTRK2Q16620 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NTRK2Q16620 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NTRK2Q16620 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
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