Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
NEDD8Q15843 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
NEDD8Q15843 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
NEDD8Q15843 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
NEDD8Q15843 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NEDD8Q15843 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NEDD8Q15843 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NEDD8Q15843 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NEDD8Q15843 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NEDD8Q15843 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NEDD8Q15843 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NEDD8Q15843 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NEDD8Q15843 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NEDD8Q15843 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NEDD8Q15843 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NEDD8Q15843 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
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NEDD8Q15843 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NEDD8Q15843 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NEDD8Q15843 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NEDD8Q15843 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NEDD8Q15843 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NEDD8Q15843 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NEDD8Q15843 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NEDD8Q15843 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NEDD8Q15843 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NEDD8Q15843 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NEDD8Q15843 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NEDD8Q15843 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NEDD8Q15843 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NEDD8Q15843 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
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NEDD8Q15843 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NEDD8Q15843 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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NEDD8Q15843 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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NEDD8Q15843 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NEDD8Q15843 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NEDD8Q15843 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NEDD8Q15843 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
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NEDD8Q15843 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NEDD8Q15843 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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NEDD8Q15843 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NEDD8Q15843 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
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NEDD8Q15843 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NEDD8Q15843 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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NEDD8Q15843 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
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NEDD8Q15843 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NEDD8Q15843 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NEDD8Q15843 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NEDD8Q15843 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NEDD8Q15843 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NEDD8Q15843 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NEDD8Q15843 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NEDD8Q15843 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NEDD8Q15843 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NEDD8Q15843 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NEDD8Q15843 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NEDD8Q15843 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NEDD8Q15843 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
NEDD8Q15843 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NEDD8Q15843 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NEDD8Q15843 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NEDD8Q15843 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NEDD8Q15843 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
NEDD8Q15843 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NEDD8Q15843 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NEDD8Q15843 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
NEDD8Q15843 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NEDD8Q15843 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NEDD8Q15843 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NEDD8Q15843 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NEDD8Q15843 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
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