Protein–RNA interactions for Protein: Q15714

TSC22D1, TSC22 domain family protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,073 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSC22D1Q15714 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TSC22D1Q15714 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
TSC22D1Q15714 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TSC22D1Q15714 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TSC22D1Q15714 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TSC22D1Q15714 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TSC22D1Q15714 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TSC22D1Q15714 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TSC22D1Q15714 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TSC22D1Q15714 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TSC22D1Q15714 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TSC22D1Q15714 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TSC22D1Q15714 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TSC22D1Q15714 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TSC22D1Q15714 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
TSC22D1Q15714 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
TSC22D1Q15714 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TSC22D1Q15714 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TSC22D1Q15714 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TSC22D1Q15714 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
TSC22D1Q15714 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
TSC22D1Q15714 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TSC22D1Q15714 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TSC22D1Q15714 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TSC22D1Q15714 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TSC22D1Q15714 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TSC22D1Q15714 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TSC22D1Q15714 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TSC22D1Q15714 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TSC22D1Q15714 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TSC22D1Q15714 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TSC22D1Q15714 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TSC22D1Q15714 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TSC22D1Q15714 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TSC22D1Q15714 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TSC22D1Q15714 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TSC22D1Q15714 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TSC22D1Q15714 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TSC22D1Q15714 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TSC22D1Q15714 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TSC22D1Q15714 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TSC22D1Q15714 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TSC22D1Q15714 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TSC22D1Q15714 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TSC22D1Q15714 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TSC22D1Q15714 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TSC22D1Q15714 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TSC22D1Q15714 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TSC22D1Q15714 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TSC22D1Q15714 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TSC22D1Q15714 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TSC22D1Q15714 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TSC22D1Q15714 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TSC22D1Q15714 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TSC22D1Q15714 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TSC22D1Q15714 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TSC22D1Q15714 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TSC22D1Q15714 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TSC22D1Q15714 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TSC22D1Q15714 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
TSC22D1Q15714 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TSC22D1Q15714 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TSC22D1Q15714 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TSC22D1Q15714 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TSC22D1Q15714 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TSC22D1Q15714 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TSC22D1Q15714 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
TSC22D1Q15714 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TSC22D1Q15714 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TSC22D1Q15714 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TSC22D1Q15714 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TSC22D1Q15714 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TSC22D1Q15714 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TSC22D1Q15714 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TSC22D1Q15714 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TSC22D1Q15714 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TSC22D1Q15714 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TSC22D1Q15714 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TSC22D1Q15714 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TSC22D1Q15714 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TSC22D1Q15714 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TSC22D1Q15714 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TSC22D1Q15714 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TSC22D1Q15714 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TSC22D1Q15714 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TSC22D1Q15714 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.03■□□□□ -0
TSC22D1Q15714 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TSC22D1Q15714 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TSC22D1Q15714 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TSC22D1Q15714 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TSC22D1Q15714 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TSC22D1Q15714 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TSC22D1Q15714 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TSC22D1Q15714 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TSC22D1Q15714 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
TSC22D1Q15714 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TSC22D1Q15714 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TSC22D1Q15714 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TSC22D1Q15714 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TSC22D1Q15714 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms