Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
HDAC1Q13547 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
HDAC1Q13547 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
HDAC1Q13547 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
HDAC1Q13547 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
HDAC1Q13547 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
HDAC1Q13547 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
HDAC1Q13547 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
HDAC1Q13547 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
HDAC1Q13547 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
HDAC1Q13547 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
HDAC1Q13547 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
HDAC1Q13547 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
HDAC1Q13547 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
HDAC1Q13547 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
HDAC1Q13547 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
HDAC1Q13547 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
HDAC1Q13547 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
HDAC1Q13547 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
HDAC1Q13547 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
HDAC1Q13547 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
HDAC1Q13547 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
HDAC1Q13547 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
HDAC1Q13547 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
HDAC1Q13547 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
HDAC1Q13547 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
HDAC1Q13547 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC20.68■□□□□ 0.9
HDAC1Q13547 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
HDAC1Q13547 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
HDAC1Q13547 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
HDAC1Q13547 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
HDAC1Q13547 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
HDAC1Q13547 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
HDAC1Q13547 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
HDAC1Q13547 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
HDAC1Q13547 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
HDAC1Q13547 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
HDAC1Q13547 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
HDAC1Q13547 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
HDAC1Q13547 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
HDAC1Q13547 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
HDAC1Q13547 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
HDAC1Q13547 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
HDAC1Q13547 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
HDAC1Q13547 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
HDAC1Q13547 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
HDAC1Q13547 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
HDAC1Q13547 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
HDAC1Q13547 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
HDAC1Q13547 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC20.67■□□□□ 0.9
HDAC1Q13547 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
HDAC1Q13547 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.67■□□□□ 0.9
HDAC1Q13547 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
HDAC1Q13547 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
HDAC1Q13547 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
HDAC1Q13547 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
HDAC1Q13547 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
HDAC1Q13547 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
HDAC1Q13547 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
HDAC1Q13547 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
HDAC1Q13547 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
HDAC1Q13547 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
HDAC1Q13547 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
HDAC1Q13547 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
HDAC1Q13547 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
HDAC1Q13547 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
HDAC1Q13547 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
HDAC1Q13547 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
HDAC1Q13547 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
HDAC1Q13547 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
HDAC1Q13547 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
HDAC1Q13547 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
HDAC1Q13547 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
HDAC1Q13547 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
HDAC1Q13547 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
HDAC1Q13547 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
HDAC1Q13547 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
HDAC1Q13547 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
HDAC1Q13547 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
HDAC1Q13547 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
HDAC1Q13547 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
HDAC1Q13547 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
HDAC1Q13547 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
HDAC1Q13547 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
HDAC1Q13547 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
HDAC1Q13547 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
HDAC1Q13547 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
HDAC1Q13547 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
HDAC1Q13547 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
HDAC1Q13547 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
HDAC1Q13547 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
HDAC1Q13547 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
HDAC1Q13547 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
HDAC1Q13547 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
HDAC1Q13547 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
HDAC1Q13547 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
HDAC1Q13547 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
HDAC1Q13547 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
HDAC1Q13547 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
HDAC1Q13547 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
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