Protein–RNA interactions for Protein: Q12879

GRIN2A, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, humanhuman

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Length 1,464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2AQ12879 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
GRIN2AQ12879 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC26.36■■□□□ 1.81
GRIN2AQ12879 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
GRIN2AQ12879 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
GRIN2AQ12879 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
GRIN2AQ12879 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
GRIN2AQ12879 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
GRIN2AQ12879 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
GRIN2AQ12879 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
GRIN2AQ12879 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
GRIN2AQ12879 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
GRIN2AQ12879 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
GRIN2AQ12879 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
GRIN2AQ12879 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
GRIN2AQ12879 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
GRIN2AQ12879 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
GRIN2AQ12879 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
GRIN2AQ12879 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC26.36■■□□□ 1.81
GRIN2AQ12879 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
GRIN2AQ12879 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
GRIN2AQ12879 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
GRIN2AQ12879 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
GRIN2AQ12879 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC26.35■■□□□ 1.81
GRIN2AQ12879 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GRIN2AQ12879 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
GRIN2AQ12879 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
GRIN2AQ12879 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GRIN2AQ12879 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GRIN2AQ12879 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
GRIN2AQ12879 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GRIN2AQ12879 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GRIN2AQ12879 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
GRIN2AQ12879 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GRIN2AQ12879 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GRIN2AQ12879 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GRIN2AQ12879 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
GRIN2AQ12879 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
GRIN2AQ12879 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
GRIN2AQ12879 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GRIN2AQ12879 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GRIN2AQ12879 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GRIN2AQ12879 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
GRIN2AQ12879 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GRIN2AQ12879 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GRIN2AQ12879 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
GRIN2AQ12879 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GRIN2AQ12879 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
GRIN2AQ12879 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GRIN2AQ12879 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
GRIN2AQ12879 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
GRIN2AQ12879 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
GRIN2AQ12879 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
GRIN2AQ12879 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
GRIN2AQ12879 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
GRIN2AQ12879 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
GRIN2AQ12879 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
GRIN2AQ12879 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
GRIN2AQ12879 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
GRIN2AQ12879 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
GRIN2AQ12879 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
GRIN2AQ12879 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
GRIN2AQ12879 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
GRIN2AQ12879 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC26.34■■□□□ 1.81
GRIN2AQ12879 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GRIN2AQ12879 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GRIN2AQ12879 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
GRIN2AQ12879 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
GRIN2AQ12879 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
GRIN2AQ12879 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
GRIN2AQ12879 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
GRIN2AQ12879 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
GRIN2AQ12879 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
GRIN2AQ12879 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
GRIN2AQ12879 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
GRIN2AQ12879 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
GRIN2AQ12879 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
GRIN2AQ12879 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
GRIN2AQ12879 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
GRIN2AQ12879 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
GRIN2AQ12879 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
GRIN2AQ12879 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
GRIN2AQ12879 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
GRIN2AQ12879 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
GRIN2AQ12879 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.8
GRIN2AQ12879 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
GRIN2AQ12879 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
GRIN2AQ12879 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
GRIN2AQ12879 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
GRIN2AQ12879 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
GRIN2AQ12879 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
GRIN2AQ12879 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
GRIN2AQ12879 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
GRIN2AQ12879 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
GRIN2AQ12879 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
GRIN2AQ12879 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
GRIN2AQ12879 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
GRIN2AQ12879 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
GRIN2AQ12879 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
GRIN2AQ12879 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
GRIN2AQ12879 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
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