Protein–RNA interactions for Protein: Q07654

TFF3, Trefoil factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 80 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFF3Q07654 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
TFF3Q07654 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
TFF3Q07654 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TFF3Q07654 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
TFF3Q07654 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TFF3Q07654 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
TFF3Q07654 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TFF3Q07654 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TFF3Q07654 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TFF3Q07654 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TFF3Q07654 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TFF3Q07654 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TFF3Q07654 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TFF3Q07654 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TFF3Q07654 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TFF3Q07654 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TFF3Q07654 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TFF3Q07654 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
TFF3Q07654 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TFF3Q07654 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TFF3Q07654 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TFF3Q07654 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TFF3Q07654 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TFF3Q07654 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TFF3Q07654 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TFF3Q07654 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TFF3Q07654 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TFF3Q07654 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TFF3Q07654 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TFF3Q07654 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TFF3Q07654 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TFF3Q07654 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TFF3Q07654 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TFF3Q07654 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TFF3Q07654 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TFF3Q07654 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TFF3Q07654 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TFF3Q07654 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TFF3Q07654 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TFF3Q07654 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
TFF3Q07654 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TFF3Q07654 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TFF3Q07654 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TFF3Q07654 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
TFF3Q07654 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TFF3Q07654 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
TFF3Q07654 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
TFF3Q07654 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TFF3Q07654 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
TFF3Q07654 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TFF3Q07654 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
TFF3Q07654 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TFF3Q07654 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TFF3Q07654 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TFF3Q07654 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TFF3Q07654 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TFF3Q07654 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TFF3Q07654 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TFF3Q07654 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TFF3Q07654 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TFF3Q07654 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TFF3Q07654 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TFF3Q07654 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TFF3Q07654 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TFF3Q07654 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TFF3Q07654 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TFF3Q07654 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TFF3Q07654 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TFF3Q07654 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TFF3Q07654 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TFF3Q07654 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TFF3Q07654 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TFF3Q07654 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TFF3Q07654 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TFF3Q07654 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TFF3Q07654 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TFF3Q07654 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TFF3Q07654 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TFF3Q07654 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TFF3Q07654 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TFF3Q07654 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TFF3Q07654 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TFF3Q07654 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TFF3Q07654 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
TFF3Q07654 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TFF3Q07654 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TFF3Q07654 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
TFF3Q07654 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TFF3Q07654 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TFF3Q07654 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
TFF3Q07654 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TFF3Q07654 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
TFF3Q07654 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TFF3Q07654 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
TFF3Q07654 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TFF3Q07654 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TFF3Q07654 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TFF3Q07654 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
TFF3Q07654 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
TFF3Q07654 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms