Protein–RNA interactions for Protein: Q07002

CDK18, Cyclin-dependent kinase 18, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK18Q07002 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK18Q07002 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK18Q07002 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK18Q07002 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK18Q07002 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK18Q07002 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK18Q07002 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK18Q07002 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK18Q07002 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK18Q07002 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK18Q07002 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK18Q07002 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK18Q07002 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK18Q07002 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK18Q07002 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK18Q07002 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK18Q07002 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK18Q07002 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK18Q07002 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK18Q07002 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK18Q07002 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK18Q07002 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK18Q07002 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK18Q07002 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK18Q07002 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK18Q07002 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK18Q07002 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK18Q07002 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK18Q07002 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK18Q07002 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK18Q07002 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK18Q07002 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK18Q07002 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK18Q07002 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK18Q07002 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK18Q07002 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK18Q07002 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK18Q07002 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK18Q07002 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK18Q07002 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK18Q07002 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK18Q07002 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK18Q07002 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK18Q07002 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK18Q07002 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK18Q07002 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK18Q07002 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK18Q07002 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK18Q07002 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK18Q07002 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK18Q07002 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK18Q07002 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK18Q07002 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK18Q07002 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK18Q07002 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK18Q07002 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK18Q07002 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK18Q07002 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK18Q07002 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK18Q07002 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK18Q07002 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK18Q07002 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK18Q07002 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK18Q07002 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK18Q07002 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDK18Q07002 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDK18Q07002 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDK18Q07002 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDK18Q07002 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDK18Q07002 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDK18Q07002 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDK18Q07002 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDK18Q07002 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDK18Q07002 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDK18Q07002 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDK18Q07002 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDK18Q07002 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDK18Q07002 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDK18Q07002 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDK18Q07002 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDK18Q07002 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDK18Q07002 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDK18Q07002 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDK18Q07002 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CDK18Q07002 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CDK18Q07002 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDK18Q07002 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDK18Q07002 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDK18Q07002 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDK18Q07002 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CDK18Q07002 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDK18Q07002 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDK18Q07002 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDK18Q07002 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDK18Q07002 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDK18Q07002 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDK18Q07002 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDK18Q07002 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDK18Q07002 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDK18Q07002 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms