Protein–RNA interactions for Protein: Q07001

CHRND, Acetylcholine receptor subunit delta, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNDQ07001 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHRNDQ07001 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHRNDQ07001 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHRNDQ07001 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHRNDQ07001 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHRNDQ07001 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHRNDQ07001 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHRNDQ07001 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHRNDQ07001 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHRNDQ07001 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHRNDQ07001 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHRNDQ07001 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHRNDQ07001 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHRNDQ07001 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CHRNDQ07001 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CHRNDQ07001 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CHRNDQ07001 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CHRNDQ07001 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CHRNDQ07001 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CHRNDQ07001 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CHRNDQ07001 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CHRNDQ07001 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CHRNDQ07001 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CHRNDQ07001 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CHRNDQ07001 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CHRNDQ07001 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CHRNDQ07001 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CHRNDQ07001 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CHRNDQ07001 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CHRNDQ07001 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CHRNDQ07001 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CHRNDQ07001 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CHRNDQ07001 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CHRNDQ07001 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CHRNDQ07001 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CHRNDQ07001 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CHRNDQ07001 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CHRNDQ07001 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CHRNDQ07001 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CHRNDQ07001 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CHRNDQ07001 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CHRNDQ07001 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CHRNDQ07001 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CHRNDQ07001 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CHRNDQ07001 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CHRNDQ07001 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CHRNDQ07001 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHRNDQ07001 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHRNDQ07001 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHRNDQ07001 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHRNDQ07001 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHRNDQ07001 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHRNDQ07001 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHRNDQ07001 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CHRNDQ07001 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHRNDQ07001 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHRNDQ07001 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHRNDQ07001 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHRNDQ07001 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHRNDQ07001 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHRNDQ07001 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHRNDQ07001 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CHRNDQ07001 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CHRNDQ07001 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHRNDQ07001 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHRNDQ07001 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHRNDQ07001 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHRNDQ07001 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHRNDQ07001 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHRNDQ07001 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHRNDQ07001 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHRNDQ07001 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHRNDQ07001 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHRNDQ07001 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHRNDQ07001 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CHRNDQ07001 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHRNDQ07001 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHRNDQ07001 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHRNDQ07001 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHRNDQ07001 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHRNDQ07001 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CHRNDQ07001 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHRNDQ07001 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHRNDQ07001 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHRNDQ07001 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHRNDQ07001 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHRNDQ07001 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHRNDQ07001 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHRNDQ07001 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHRNDQ07001 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHRNDQ07001 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHRNDQ07001 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CHRNDQ07001 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHRNDQ07001 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHRNDQ07001 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHRNDQ07001 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CHRNDQ07001 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHRNDQ07001 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHRNDQ07001 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHRNDQ07001 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms