Protein–RNA interactions for Protein: Q05D32

CTDSPL2, CTD small phosphatase-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL2Q05D32 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CTDSPL2Q05D32 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CTDSPL2Q05D32 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
CTDSPL2Q05D32 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CTDSPL2Q05D32 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CTDSPL2Q05D32 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CTDSPL2Q05D32 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CTDSPL2Q05D32 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CTDSPL2Q05D32 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CTDSPL2Q05D32 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CTDSPL2Q05D32 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
CTDSPL2Q05D32 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CTDSPL2Q05D32 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CTDSPL2Q05D32 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CTDSPL2Q05D32 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CTDSPL2Q05D32 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CTDSPL2Q05D32 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CTDSPL2Q05D32 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CTDSPL2Q05D32 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CTDSPL2Q05D32 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CTDSPL2Q05D32 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CTDSPL2Q05D32 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CTDSPL2Q05D32 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CTDSPL2Q05D32 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CTDSPL2Q05D32 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CTDSPL2Q05D32 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CTDSPL2Q05D32 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CTDSPL2Q05D32 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CTDSPL2Q05D32 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CTDSPL2Q05D32 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CTDSPL2Q05D32 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
CTDSPL2Q05D32 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CTDSPL2Q05D32 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
CTDSPL2Q05D32 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CTDSPL2Q05D32 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
CTDSPL2Q05D32 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CTDSPL2Q05D32 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CTDSPL2Q05D32 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CTDSPL2Q05D32 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CTDSPL2Q05D32 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CTDSPL2Q05D32 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CTDSPL2Q05D32 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CTDSPL2Q05D32 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CTDSPL2Q05D32 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CTDSPL2Q05D32 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CTDSPL2Q05D32 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CTDSPL2Q05D32 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CTDSPL2Q05D32 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CTDSPL2Q05D32 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CTDSPL2Q05D32 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CTDSPL2Q05D32 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CTDSPL2Q05D32 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CTDSPL2Q05D32 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CTDSPL2Q05D32 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CTDSPL2Q05D32 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CTDSPL2Q05D32 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CTDSPL2Q05D32 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CTDSPL2Q05D32 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
CTDSPL2Q05D32 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CTDSPL2Q05D32 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CTDSPL2Q05D32 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CTDSPL2Q05D32 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CTDSPL2Q05D32 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CTDSPL2Q05D32 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CTDSPL2Q05D32 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
CTDSPL2Q05D32 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CTDSPL2Q05D32 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CTDSPL2Q05D32 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CTDSPL2Q05D32 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CTDSPL2Q05D32 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CTDSPL2Q05D32 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CTDSPL2Q05D32 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CTDSPL2Q05D32 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CTDSPL2Q05D32 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CTDSPL2Q05D32 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CTDSPL2Q05D32 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CTDSPL2Q05D32 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CTDSPL2Q05D32 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CTDSPL2Q05D32 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CTDSPL2Q05D32 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CTDSPL2Q05D32 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CTDSPL2Q05D32 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CTDSPL2Q05D32 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CTDSPL2Q05D32 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CTDSPL2Q05D32 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CTDSPL2Q05D32 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CTDSPL2Q05D32 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CTDSPL2Q05D32 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CTDSPL2Q05D32 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CTDSPL2Q05D32 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CTDSPL2Q05D32 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CTDSPL2Q05D32 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CTDSPL2Q05D32 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CTDSPL2Q05D32 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CTDSPL2Q05D32 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CTDSPL2Q05D32 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CTDSPL2Q05D32 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CTDSPL2Q05D32 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CTDSPL2Q05D32 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CTDSPL2Q05D32 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms