Protein–RNA interactions for Protein: Q05086

UBE3A, Ubiquitin-protein ligase E3A, humanhuman

Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3AQ05086 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
UBE3AQ05086 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
UBE3AQ05086 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
UBE3AQ05086 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
UBE3AQ05086 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
UBE3AQ05086 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
UBE3AQ05086 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
UBE3AQ05086 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
UBE3AQ05086 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
UBE3AQ05086 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
UBE3AQ05086 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
UBE3AQ05086 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
UBE3AQ05086 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
UBE3AQ05086 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
UBE3AQ05086 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
UBE3AQ05086 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
UBE3AQ05086 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
UBE3AQ05086 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
UBE3AQ05086 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
UBE3AQ05086 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
UBE3AQ05086 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
UBE3AQ05086 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
UBE3AQ05086 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
UBE3AQ05086 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
UBE3AQ05086 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
UBE3AQ05086 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
UBE3AQ05086 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
UBE3AQ05086 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
UBE3AQ05086 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
UBE3AQ05086 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
UBE3AQ05086 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
UBE3AQ05086 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
UBE3AQ05086 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
UBE3AQ05086 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
UBE3AQ05086 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
UBE3AQ05086 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
UBE3AQ05086 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
UBE3AQ05086 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
UBE3AQ05086 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
UBE3AQ05086 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
UBE3AQ05086 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
UBE3AQ05086 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
UBE3AQ05086 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
UBE3AQ05086 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
UBE3AQ05086 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
UBE3AQ05086 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
UBE3AQ05086 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
UBE3AQ05086 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
UBE3AQ05086 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
UBE3AQ05086 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
UBE3AQ05086 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
UBE3AQ05086 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
UBE3AQ05086 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
UBE3AQ05086 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
UBE3AQ05086 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
UBE3AQ05086 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
UBE3AQ05086 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
UBE3AQ05086 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
UBE3AQ05086 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
UBE3AQ05086 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
UBE3AQ05086 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
UBE3AQ05086 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
UBE3AQ05086 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
UBE3AQ05086 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
UBE3AQ05086 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
UBE3AQ05086 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
UBE3AQ05086 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
UBE3AQ05086 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
UBE3AQ05086 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
UBE3AQ05086 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
UBE3AQ05086 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
UBE3AQ05086 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
UBE3AQ05086 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
UBE3AQ05086 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
UBE3AQ05086 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
UBE3AQ05086 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
UBE3AQ05086 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
UBE3AQ05086 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
UBE3AQ05086 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
UBE3AQ05086 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
UBE3AQ05086 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
UBE3AQ05086 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
UBE3AQ05086 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
UBE3AQ05086 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
UBE3AQ05086 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
UBE3AQ05086 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
UBE3AQ05086 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
UBE3AQ05086 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
UBE3AQ05086 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
UBE3AQ05086 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
UBE3AQ05086 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
UBE3AQ05086 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
UBE3AQ05086 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
UBE3AQ05086 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
UBE3AQ05086 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
UBE3AQ05086 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
UBE3AQ05086 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
UBE3AQ05086 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
UBE3AQ05086 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
UBE3AQ05086 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms