Protein–RNA interactions for Protein: Q04900

CD164, Sialomucin core protein 24, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD164Q04900 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC10.02□□□□□ -0.81
CD164Q04900 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
CD164Q04900 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
CD164Q04900 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
CD164Q04900 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
CD164Q04900 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
CD164Q04900 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
CD164Q04900 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
CD164Q04900 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
CD164Q04900 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
CD164Q04900 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
CD164Q04900 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
CD164Q04900 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
CD164Q04900 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
CD164Q04900 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
CD164Q04900 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
CD164Q04900 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
CD164Q04900 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
CD164Q04900 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
CD164Q04900 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
CD164Q04900 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
CD164Q04900 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
CD164Q04900 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
CD164Q04900 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
CD164Q04900 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
CD164Q04900 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
CD164Q04900 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
CD164Q04900 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
CD164Q04900 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
CD164Q04900 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
CD164Q04900 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
CD164Q04900 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
CD164Q04900 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
CD164Q04900 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
CD164Q04900 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
CD164Q04900 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
CD164Q04900 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
CD164Q04900 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
CD164Q04900 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
CD164Q04900 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
CD164Q04900 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
CD164Q04900 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
CD164Q04900 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
CD164Q04900 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
CD164Q04900 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
CD164Q04900 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
CD164Q04900 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
CD164Q04900 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
CD164Q04900 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
CD164Q04900 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
CD164Q04900 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
CD164Q04900 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
CD164Q04900 RCAN3-207ENST00000538532 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
CD164Q04900 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
CD164Q04900 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
CD164Q04900 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
CD164Q04900 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
CD164Q04900 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
CD164Q04900 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
CD164Q04900 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
CD164Q04900 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
CD164Q04900 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
CD164Q04900 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
CD164Q04900 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
CD164Q04900 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
CD164Q04900 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
CD164Q04900 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
CD164Q04900 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
CD164Q04900 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
CD164Q04900 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
CD164Q04900 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
CD164Q04900 KCNIP3-201ENST00000295225 2940 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
CD164Q04900 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
CD164Q04900 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
CD164Q04900 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
CD164Q04900 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
CD164Q04900 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
CD164Q04900 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
CD164Q04900 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
CD164Q04900 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
CD164Q04900 MARK4-201ENST00000262891 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
CD164Q04900 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
CD164Q04900 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
CD164Q04900 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
CD164Q04900 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
CD164Q04900 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
CD164Q04900 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
CD164Q04900 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
CD164Q04900 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
CD164Q04900 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
CD164Q04900 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
CD164Q04900 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
CD164Q04900 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
CD164Q04900 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
CD164Q04900 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC10.01□□□□□ -0.81
CD164Q04900 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
CD164Q04900 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
CD164Q04900 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
CD164Q04900 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
CD164Q04900 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms