Protein–RNA interactions for Protein: Q04656

ATP7A, Copper-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP7AQ04656 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATP7AQ04656 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
ATP7AQ04656 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATP7AQ04656 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATP7AQ04656 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATP7AQ04656 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
ATP7AQ04656 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATP7AQ04656 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATP7AQ04656 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATP7AQ04656 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATP7AQ04656 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATP7AQ04656 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATP7AQ04656 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATP7AQ04656 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATP7AQ04656 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
ATP7AQ04656 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATP7AQ04656 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATP7AQ04656 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATP7AQ04656 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATP7AQ04656 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATP7AQ04656 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATP7AQ04656 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATP7AQ04656 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATP7AQ04656 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATP7AQ04656 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATP7AQ04656 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATP7AQ04656 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATP7AQ04656 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATP7AQ04656 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATP7AQ04656 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATP7AQ04656 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATP7AQ04656 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATP7AQ04656 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATP7AQ04656 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATP7AQ04656 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATP7AQ04656 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATP7AQ04656 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATP7AQ04656 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATP7AQ04656 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATP7AQ04656 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATP7AQ04656 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATP7AQ04656 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATP7AQ04656 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATP7AQ04656 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
ATP7AQ04656 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATP7AQ04656 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATP7AQ04656 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATP7AQ04656 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATP7AQ04656 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATP7AQ04656 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATP7AQ04656 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATP7AQ04656 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATP7AQ04656 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
ATP7AQ04656 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
ATP7AQ04656 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATP7AQ04656 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATP7AQ04656 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATP7AQ04656 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATP7AQ04656 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
ATP7AQ04656 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATP7AQ04656 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATP7AQ04656 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
ATP7AQ04656 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATP7AQ04656 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATP7AQ04656 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATP7AQ04656 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATP7AQ04656 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATP7AQ04656 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATP7AQ04656 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATP7AQ04656 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATP7AQ04656 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP7AQ04656 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP7AQ04656 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP7AQ04656 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP7AQ04656 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP7AQ04656 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP7AQ04656 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP7AQ04656 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP7AQ04656 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP7AQ04656 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP7AQ04656 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP7AQ04656 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP7AQ04656 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP7AQ04656 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP7AQ04656 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP7AQ04656 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP7AQ04656 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP7AQ04656 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP7AQ04656 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP7AQ04656 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP7AQ04656 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP7AQ04656 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP7AQ04656 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP7AQ04656 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP7AQ04656 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP7AQ04656 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP7AQ04656 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATP7AQ04656 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATP7AQ04656 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATP7AQ04656 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms