Protein–RNA interactions for Protein: Q03468

ERCC6, DNA excision repair protein ERCC-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC6Q03468 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
ERCC6Q03468 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
ERCC6Q03468 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
ERCC6Q03468 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
ERCC6Q03468 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ERCC6Q03468 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ERCC6Q03468 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ERCC6Q03468 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ERCC6Q03468 AC026904.3-201ENST00000636550 1530 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ERCC6Q03468 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ERCC6Q03468 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ERCC6Q03468 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ERCC6Q03468 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ERCC6Q03468 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ERCC6Q03468 AC069218.1-201ENST00000435269 762 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
ERCC6Q03468 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ERCC6Q03468 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ERCC6Q03468 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ERCC6Q03468 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
ERCC6Q03468 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ERCC6Q03468 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ERCC6Q03468 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ERCC6Q03468 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ERCC6Q03468 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ERCC6Q03468 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ERCC6Q03468 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ERCC6Q03468 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ERCC6Q03468 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ERCC6Q03468 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ERCC6Q03468 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
ERCC6Q03468 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ERCC6Q03468 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ERCC6Q03468 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ERCC6Q03468 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ERCC6Q03468 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ERCC6Q03468 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ERCC6Q03468 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ERCC6Q03468 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ERCC6Q03468 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ERCC6Q03468 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ERCC6Q03468 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ERCC6Q03468 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ERCC6Q03468 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ERCC6Q03468 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
ERCC6Q03468 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ERCC6Q03468 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ERCC6Q03468 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
ERCC6Q03468 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ERCC6Q03468 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ERCC6Q03468 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ERCC6Q03468 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ERCC6Q03468 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ERCC6Q03468 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ERCC6Q03468 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ERCC6Q03468 AK1-202ENST00000373156 757 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ERCC6Q03468 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ERCC6Q03468 AC116609.2-201ENST00000431542 256 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ERCC6Q03468 AC243961.1-201ENST00000432559 384 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ERCC6Q03468 AC245056.1-201ENST00000437631 384 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ERCC6Q03468 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ERCC6Q03468 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
ERCC6Q03468 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ERCC6Q03468 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ERCC6Q03468 EIF3K-202ENST00000538434 966 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ERCC6Q03468 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ERCC6Q03468 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ERCC6Q03468 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
ERCC6Q03468 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ERCC6Q03468 CCDC197-205ENST00000636493 1279 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ERCC6Q03468 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ERCC6Q03468 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ERCC6Q03468 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ERCC6Q03468 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ERCC6Q03468 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ERCC6Q03468 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ERCC6Q03468 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ERCC6Q03468 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ERCC6Q03468 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ERCC6Q03468 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ERCC6Q03468 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ERCC6Q03468 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ERCC6Q03468 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ERCC6Q03468 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ERCC6Q03468 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ERCC6Q03468 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
ERCC6Q03468 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ERCC6Q03468 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
ERCC6Q03468 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ERCC6Q03468 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ERCC6Q03468 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ERCC6Q03468 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ERCC6Q03468 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ERCC6Q03468 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ERCC6Q03468 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ERCC6Q03468 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
ERCC6Q03468 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ERCC6Q03468 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ERCC6Q03468 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
ERCC6Q03468 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ERCC6Q03468 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms