Protein–RNA interactions for Protein: Q02809

PLOD1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLOD1Q02809 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PLOD1Q02809 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PLOD1Q02809 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PLOD1Q02809 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PLOD1Q02809 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PLOD1Q02809 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PLOD1Q02809 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PLOD1Q02809 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PLOD1Q02809 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PLOD1Q02809 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PLOD1Q02809 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PLOD1Q02809 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PLOD1Q02809 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PLOD1Q02809 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PLOD1Q02809 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PLOD1Q02809 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PLOD1Q02809 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PLOD1Q02809 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PLOD1Q02809 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PLOD1Q02809 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PLOD1Q02809 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PLOD1Q02809 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PLOD1Q02809 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PLOD1Q02809 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PLOD1Q02809 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PLOD1Q02809 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PLOD1Q02809 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PLOD1Q02809 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PLOD1Q02809 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PLOD1Q02809 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PLOD1Q02809 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PLOD1Q02809 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PLOD1Q02809 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PLOD1Q02809 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PLOD1Q02809 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PLOD1Q02809 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PLOD1Q02809 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PLOD1Q02809 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PLOD1Q02809 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PLOD1Q02809 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PLOD1Q02809 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PLOD1Q02809 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PLOD1Q02809 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PLOD1Q02809 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PLOD1Q02809 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PLOD1Q02809 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PLOD1Q02809 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PLOD1Q02809 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PLOD1Q02809 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PLOD1Q02809 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PLOD1Q02809 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PLOD1Q02809 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PLOD1Q02809 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PLOD1Q02809 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PLOD1Q02809 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PLOD1Q02809 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PLOD1Q02809 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PLOD1Q02809 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PLOD1Q02809 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PLOD1Q02809 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PLOD1Q02809 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PLOD1Q02809 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PLOD1Q02809 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PLOD1Q02809 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
PLOD1Q02809 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
PLOD1Q02809 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
PLOD1Q02809 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
PLOD1Q02809 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PLOD1Q02809 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PLOD1Q02809 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PLOD1Q02809 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PLOD1Q02809 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PLOD1Q02809 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PLOD1Q02809 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PLOD1Q02809 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PLOD1Q02809 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PLOD1Q02809 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PLOD1Q02809 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PLOD1Q02809 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PLOD1Q02809 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PLOD1Q02809 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PLOD1Q02809 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PLOD1Q02809 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PLOD1Q02809 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PLOD1Q02809 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PLOD1Q02809 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PLOD1Q02809 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PLOD1Q02809 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PLOD1Q02809 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PLOD1Q02809 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PLOD1Q02809 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PLOD1Q02809 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PLOD1Q02809 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PLOD1Q02809 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PLOD1Q02809 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PLOD1Q02809 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PLOD1Q02809 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PLOD1Q02809 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PLOD1Q02809 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PLOD1Q02809 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms