Protein–RNA interactions for Protein: P63162

SNRPN, Small nuclear ribonucleoprotein-associated protein N, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPNP63162 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SNRPNP63162 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SNRPNP63162 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SNRPNP63162 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SNRPNP63162 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SNRPNP63162 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SNRPNP63162 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SNRPNP63162 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SNRPNP63162 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SNRPNP63162 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SNRPNP63162 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SNRPNP63162 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SNRPNP63162 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SNRPNP63162 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SNRPNP63162 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SNRPNP63162 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SNRPNP63162 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SNRPNP63162 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SNRPNP63162 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SNRPNP63162 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SNRPNP63162 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SNRPNP63162 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SNRPNP63162 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SNRPNP63162 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SNRPNP63162 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SNRPNP63162 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SNRPNP63162 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SNRPNP63162 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SNRPNP63162 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SNRPNP63162 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SNRPNP63162 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SNRPNP63162 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SNRPNP63162 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SNRPNP63162 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SNRPNP63162 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SNRPNP63162 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SNRPNP63162 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SNRPNP63162 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SNRPNP63162 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SNRPNP63162 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SNRPNP63162 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SNRPNP63162 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SNRPNP63162 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SNRPNP63162 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SNRPNP63162 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SNRPNP63162 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNRPNP63162 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNRPNP63162 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNRPNP63162 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNRPNP63162 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNRPNP63162 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNRPNP63162 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNRPNP63162 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNRPNP63162 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNRPNP63162 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNRPNP63162 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNRPNP63162 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNRPNP63162 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNRPNP63162 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNRPNP63162 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNRPNP63162 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNRPNP63162 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNRPNP63162 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNRPNP63162 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNRPNP63162 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNRPNP63162 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SNRPNP63162 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNRPNP63162 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SNRPNP63162 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNRPNP63162 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SNRPNP63162 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNRPNP63162 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNRPNP63162 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SNRPNP63162 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SNRPNP63162 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SNRPNP63162 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SNRPNP63162 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNRPNP63162 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SNRPNP63162 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNRPNP63162 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNRPNP63162 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNRPNP63162 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNRPNP63162 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNRPNP63162 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNRPNP63162 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNRPNP63162 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNRPNP63162 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNRPNP63162 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNRPNP63162 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNRPNP63162 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNRPNP63162 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNRPNP63162 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNRPNP63162 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNRPNP63162 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNRPNP63162 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNRPNP63162 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNRPNP63162 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNRPNP63162 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNRPNP63162 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNRPNP63162 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms