Protein–RNA interactions for Protein: P58499

FAM3B, Protein FAM3B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3BP58499 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
FAM3BP58499 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms