Protein–RNA interactions for Protein: P57796

CABP4, Calcium-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CABP4P57796 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CABP4P57796 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CABP4P57796 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CABP4P57796 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CABP4P57796 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CABP4P57796 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CABP4P57796 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CABP4P57796 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CABP4P57796 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CABP4P57796 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CABP4P57796 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CABP4P57796 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CABP4P57796 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CABP4P57796 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CABP4P57796 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CABP4P57796 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CABP4P57796 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CABP4P57796 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CABP4P57796 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CABP4P57796 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CABP4P57796 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CABP4P57796 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CABP4P57796 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CABP4P57796 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CABP4P57796 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CABP4P57796 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CABP4P57796 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CABP4P57796 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CABP4P57796 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CABP4P57796 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CABP4P57796 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CABP4P57796 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CABP4P57796 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CABP4P57796 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CABP4P57796 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CABP4P57796 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CABP4P57796 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CABP4P57796 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CABP4P57796 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CABP4P57796 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CABP4P57796 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CABP4P57796 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CABP4P57796 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CABP4P57796 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CABP4P57796 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CABP4P57796 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CABP4P57796 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CABP4P57796 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CABP4P57796 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CABP4P57796 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CABP4P57796 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CABP4P57796 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CABP4P57796 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CABP4P57796 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CABP4P57796 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CABP4P57796 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CABP4P57796 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CABP4P57796 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CABP4P57796 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CABP4P57796 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CABP4P57796 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CABP4P57796 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CABP4P57796 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CABP4P57796 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CABP4P57796 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CABP4P57796 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CABP4P57796 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CABP4P57796 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CABP4P57796 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CABP4P57796 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CABP4P57796 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CABP4P57796 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CABP4P57796 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CABP4P57796 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CABP4P57796 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CABP4P57796 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CABP4P57796 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CABP4P57796 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CABP4P57796 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CABP4P57796 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CABP4P57796 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CABP4P57796 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CABP4P57796 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CABP4P57796 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CABP4P57796 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CABP4P57796 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CABP4P57796 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CABP4P57796 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CABP4P57796 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CABP4P57796 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CABP4P57796 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CABP4P57796 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CABP4P57796 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CABP4P57796 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CABP4P57796 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CABP4P57796 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CABP4P57796 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CABP4P57796 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CABP4P57796 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CABP4P57796 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms