Protein–RNA interactions for Protein: P55822

SH3BGR, SH3 domain-binding glutamic acid-rich protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BGRP55822 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SH3BGRP55822 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SH3BGRP55822 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SH3BGRP55822 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SH3BGRP55822 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SH3BGRP55822 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SH3BGRP55822 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SH3BGRP55822 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SH3BGRP55822 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SH3BGRP55822 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SH3BGRP55822 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SH3BGRP55822 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SH3BGRP55822 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SH3BGRP55822 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SH3BGRP55822 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SH3BGRP55822 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SH3BGRP55822 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SH3BGRP55822 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SH3BGRP55822 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SH3BGRP55822 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SH3BGRP55822 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SH3BGRP55822 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SH3BGRP55822 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SH3BGRP55822 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SH3BGRP55822 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SH3BGRP55822 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SH3BGRP55822 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SH3BGRP55822 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SH3BGRP55822 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SH3BGRP55822 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SH3BGRP55822 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SH3BGRP55822 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SH3BGRP55822 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SH3BGRP55822 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SH3BGRP55822 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SH3BGRP55822 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SH3BGRP55822 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SH3BGRP55822 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SH3BGRP55822 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SH3BGRP55822 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SH3BGRP55822 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SH3BGRP55822 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SH3BGRP55822 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SH3BGRP55822 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SH3BGRP55822 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SH3BGRP55822 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SH3BGRP55822 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SH3BGRP55822 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SH3BGRP55822 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SH3BGRP55822 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SH3BGRP55822 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SH3BGRP55822 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SH3BGRP55822 NPFFR1-201ENST00000277942 8921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SH3BGRP55822 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SH3BGRP55822 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SH3BGRP55822 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SH3BGRP55822 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SH3BGRP55822 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SH3BGRP55822 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SH3BGRP55822 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SH3BGRP55822 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SH3BGRP55822 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SH3BGRP55822 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SH3BGRP55822 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SH3BGRP55822 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SH3BGRP55822 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SH3BGRP55822 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SH3BGRP55822 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SH3BGRP55822 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SH3BGRP55822 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SH3BGRP55822 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SH3BGRP55822 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SH3BGRP55822 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SH3BGRP55822 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SH3BGRP55822 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SH3BGRP55822 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SH3BGRP55822 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SH3BGRP55822 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SH3BGRP55822 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SH3BGRP55822 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
SH3BGRP55822 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SH3BGRP55822 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SH3BGRP55822 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SH3BGRP55822 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SH3BGRP55822 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SH3BGRP55822 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SH3BGRP55822 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SH3BGRP55822 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SH3BGRP55822 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SH3BGRP55822 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SH3BGRP55822 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SH3BGRP55822 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SH3BGRP55822 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SH3BGRP55822 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SH3BGRP55822 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SH3BGRP55822 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SH3BGRP55822 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SH3BGRP55822 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SH3BGRP55822 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SH3BGRP55822 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms