Protein–RNA interactions for Protein: P55211

CASP9, Caspase-9, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP9P55211 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CASP9P55211 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CASP9P55211 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CASP9P55211 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CASP9P55211 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CASP9P55211 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CASP9P55211 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CASP9P55211 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CASP9P55211 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CASP9P55211 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CASP9P55211 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CASP9P55211 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CASP9P55211 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CASP9P55211 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CASP9P55211 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CASP9P55211 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CASP9P55211 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CASP9P55211 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CASP9P55211 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CASP9P55211 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CASP9P55211 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CASP9P55211 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CASP9P55211 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CASP9P55211 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CASP9P55211 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CASP9P55211 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CASP9P55211 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CASP9P55211 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CASP9P55211 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CASP9P55211 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CASP9P55211 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CASP9P55211 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CASP9P55211 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CASP9P55211 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CASP9P55211 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CASP9P55211 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CASP9P55211 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CASP9P55211 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CASP9P55211 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CASP9P55211 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CASP9P55211 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CASP9P55211 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CASP9P55211 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CASP9P55211 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CASP9P55211 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CASP9P55211 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CASP9P55211 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CASP9P55211 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CASP9P55211 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CASP9P55211 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CASP9P55211 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CASP9P55211 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CASP9P55211 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CASP9P55211 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CASP9P55211 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CASP9P55211 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CASP9P55211 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CASP9P55211 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CASP9P55211 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CASP9P55211 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CASP9P55211 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CASP9P55211 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CASP9P55211 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CASP9P55211 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CASP9P55211 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CASP9P55211 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CASP9P55211 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CASP9P55211 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CASP9P55211 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CASP9P55211 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CASP9P55211 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CASP9P55211 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CASP9P55211 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CASP9P55211 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CASP9P55211 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CASP9P55211 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CASP9P55211 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CASP9P55211 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CASP9P55211 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CASP9P55211 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CASP9P55211 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CASP9P55211 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CASP9P55211 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CASP9P55211 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CASP9P55211 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CASP9P55211 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CASP9P55211 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CASP9P55211 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CASP9P55211 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CASP9P55211 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CASP9P55211 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CASP9P55211 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CASP9P55211 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CASP9P55211 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CASP9P55211 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CASP9P55211 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CASP9P55211 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CASP9P55211 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CASP9P55211 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CASP9P55211 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms