Protein–RNA interactions for Protein: P55036

PSMD4, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD4P55036 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMD4P55036 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMD4P55036 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMD4P55036 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMD4P55036 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMD4P55036 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMD4P55036 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMD4P55036 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMD4P55036 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMD4P55036 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMD4P55036 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMD4P55036 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMD4P55036 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMD4P55036 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMD4P55036 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMD4P55036 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMD4P55036 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMD4P55036 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMD4P55036 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMD4P55036 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMD4P55036 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMD4P55036 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMD4P55036 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMD4P55036 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMD4P55036 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMD4P55036 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMD4P55036 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMD4P55036 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMD4P55036 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMD4P55036 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMD4P55036 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMD4P55036 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMD4P55036 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMD4P55036 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMD4P55036 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMD4P55036 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMD4P55036 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMD4P55036 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMD4P55036 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMD4P55036 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMD4P55036 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMD4P55036 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMD4P55036 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMD4P55036 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMD4P55036 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMD4P55036 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMD4P55036 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMD4P55036 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMD4P55036 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMD4P55036 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMD4P55036 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMD4P55036 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMD4P55036 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMD4P55036 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMD4P55036 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMD4P55036 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMD4P55036 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMD4P55036 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMD4P55036 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMD4P55036 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMD4P55036 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMD4P55036 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMD4P55036 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMD4P55036 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMD4P55036 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMD4P55036 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMD4P55036 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMD4P55036 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMD4P55036 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMD4P55036 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMD4P55036 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMD4P55036 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMD4P55036 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMD4P55036 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMD4P55036 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMD4P55036 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMD4P55036 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMD4P55036 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMD4P55036 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMD4P55036 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMD4P55036 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMD4P55036 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMD4P55036 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMD4P55036 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMD4P55036 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMD4P55036 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMD4P55036 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMD4P55036 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMD4P55036 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMD4P55036 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMD4P55036 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMD4P55036 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMD4P55036 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMD4P55036 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMD4P55036 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMD4P55036 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMD4P55036 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMD4P55036 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMD4P55036 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMD4P55036 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms