Protein–RNA interactions for Protein: P52209

PGD, 6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGDP52209 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PGDP52209 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PGDP52209 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PGDP52209 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PGDP52209 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PGDP52209 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PGDP52209 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PGDP52209 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PGDP52209 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PGDP52209 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PGDP52209 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PGDP52209 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PGDP52209 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PGDP52209 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PGDP52209 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PGDP52209 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PGDP52209 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PGDP52209 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PGDP52209 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PGDP52209 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PGDP52209 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PGDP52209 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PGDP52209 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PGDP52209 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PGDP52209 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PGDP52209 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PGDP52209 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PGDP52209 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PGDP52209 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PGDP52209 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PGDP52209 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PGDP52209 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PGDP52209 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PGDP52209 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PGDP52209 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PGDP52209 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PGDP52209 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PGDP52209 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PGDP52209 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PGDP52209 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PGDP52209 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PGDP52209 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PGDP52209 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PGDP52209 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PGDP52209 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PGDP52209 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PGDP52209 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PGDP52209 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PGDP52209 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PGDP52209 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PGDP52209 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PGDP52209 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PGDP52209 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PGDP52209 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PGDP52209 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PGDP52209 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PGDP52209 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PGDP52209 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PGDP52209 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PGDP52209 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PGDP52209 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PGDP52209 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PGDP52209 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PGDP52209 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PGDP52209 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PGDP52209 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PGDP52209 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PGDP52209 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PGDP52209 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PGDP52209 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PGDP52209 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PGDP52209 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PGDP52209 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PGDP52209 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PGDP52209 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PGDP52209 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PGDP52209 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PGDP52209 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PGDP52209 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PGDP52209 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PGDP52209 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PGDP52209 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PGDP52209 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PGDP52209 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PGDP52209 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PGDP52209 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PGDP52209 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PGDP52209 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PGDP52209 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PGDP52209 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PGDP52209 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PGDP52209 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PGDP52209 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PGDP52209 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PGDP52209 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PGDP52209 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PGDP52209 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PGDP52209 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PGDP52209 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PGDP52209 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms