Protein–RNA interactions for Protein: P49638

TTPA, Alpha-tocopherol transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAP49638 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TTPAP49638 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TTPAP49638 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TTPAP49638 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TTPAP49638 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TTPAP49638 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TTPAP49638 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TTPAP49638 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TTPAP49638 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TTPAP49638 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TTPAP49638 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TTPAP49638 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TTPAP49638 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TTPAP49638 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TTPAP49638 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TTPAP49638 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TTPAP49638 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TTPAP49638 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TTPAP49638 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TTPAP49638 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TTPAP49638 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TTPAP49638 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TTPAP49638 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TTPAP49638 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TTPAP49638 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TTPAP49638 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TTPAP49638 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TTPAP49638 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TTPAP49638 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TTPAP49638 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TTPAP49638 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TTPAP49638 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TTPAP49638 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TTPAP49638 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TTPAP49638 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TTPAP49638 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TTPAP49638 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TTPAP49638 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TTPAP49638 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TTPAP49638 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TTPAP49638 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TTPAP49638 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TTPAP49638 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TTPAP49638 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TTPAP49638 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TTPAP49638 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TTPAP49638 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TTPAP49638 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TTPAP49638 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TTPAP49638 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TTPAP49638 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TTPAP49638 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TTPAP49638 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TTPAP49638 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TTPAP49638 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TTPAP49638 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TTPAP49638 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TTPAP49638 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TTPAP49638 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TTPAP49638 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TTPAP49638 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TTPAP49638 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TTPAP49638 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TTPAP49638 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TTPAP49638 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TTPAP49638 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TTPAP49638 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TTPAP49638 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TTPAP49638 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TTPAP49638 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TTPAP49638 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TTPAP49638 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TTPAP49638 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TTPAP49638 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TTPAP49638 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TTPAP49638 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TTPAP49638 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TTPAP49638 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TTPAP49638 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TTPAP49638 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TTPAP49638 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TTPAP49638 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TTPAP49638 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TTPAP49638 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TTPAP49638 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TTPAP49638 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TTPAP49638 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TTPAP49638 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TTPAP49638 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TTPAP49638 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TTPAP49638 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TTPAP49638 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TTPAP49638 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TTPAP49638 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TTPAP49638 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TTPAP49638 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TTPAP49638 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TTPAP49638 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TTPAP49638 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TTPAP49638 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
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