Protein–RNA interactions for Protein: P48507

GCLM, Glutamate--cysteine ligase regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLMP48507 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GCLMP48507 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GCLMP48507 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GCLMP48507 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GCLMP48507 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GCLMP48507 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GCLMP48507 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GCLMP48507 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GCLMP48507 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GCLMP48507 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GCLMP48507 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GCLMP48507 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GCLMP48507 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GCLMP48507 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GCLMP48507 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GCLMP48507 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GCLMP48507 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
GCLMP48507 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GCLMP48507 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GCLMP48507 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GCLMP48507 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GCLMP48507 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GCLMP48507 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GCLMP48507 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GCLMP48507 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GCLMP48507 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GCLMP48507 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GCLMP48507 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GCLMP48507 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GCLMP48507 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GCLMP48507 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GCLMP48507 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GCLMP48507 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GCLMP48507 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GCLMP48507 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GCLMP48507 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GCLMP48507 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GCLMP48507 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GCLMP48507 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GCLMP48507 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GCLMP48507 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GCLMP48507 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GCLMP48507 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GCLMP48507 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GCLMP48507 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GCLMP48507 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GCLMP48507 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GCLMP48507 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GCLMP48507 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GCLMP48507 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GCLMP48507 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GCLMP48507 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GCLMP48507 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GCLMP48507 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
GCLMP48507 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GCLMP48507 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
GCLMP48507 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
GCLMP48507 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
GCLMP48507 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GCLMP48507 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
GCLMP48507 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
GCLMP48507 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GCLMP48507 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GCLMP48507 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
GCLMP48507 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GCLMP48507 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GCLMP48507 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GCLMP48507 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GCLMP48507 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GCLMP48507 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GCLMP48507 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GCLMP48507 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GCLMP48507 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GCLMP48507 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GCLMP48507 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GCLMP48507 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GCLMP48507 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GCLMP48507 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GCLMP48507 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GCLMP48507 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GCLMP48507 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GCLMP48507 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GCLMP48507 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GCLMP48507 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GCLMP48507 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GCLMP48507 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GCLMP48507 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GCLMP48507 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GCLMP48507 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GCLMP48507 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GCLMP48507 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GCLMP48507 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GCLMP48507 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GCLMP48507 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GCLMP48507 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GCLMP48507 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GCLMP48507 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GCLMP48507 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GCLMP48507 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GCLMP48507 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms